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Enregistrement W2118716962 · doi:10.1099/vir.0.83194-0

Genetic control of broad-spectrum resistance to turnip mosaic virus in Brassica rapa (Chinese cabbage)

2007· article· en· W2118716962 sur OpenAlexafffund
Rachel L. Rusholme, Erin E. Higgins, John A. Walsh, Derek J. Lydiate

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Environment Research CouncilResearch Councils UK
Mots-clésBrassica rapaBiologyTurnip mosaic virusBrassicaVirologyResistance (ecology)Cucumber mosaic virusBroad spectrumVirusPlant virusBotanyPotyvirusAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Brassica rapa line RLR22 was resistant to eight diverse turnip mosaic virus (TuMV) isolates. A B. rapa genetic map based on 213 marker loci segregating in 120 first back-cross (B(1)) individuals was established and aligned with the B. rapa genome reference map using some of the RFLP probes. B(1) individuals were self-pollinated to produce B(1)S(1) families. The existence of two loci controlling resistance to TuMV isolate CDN 1 was established from contrasting patterns of segregation for resistance and susceptibility in the B(1)S(1) families. The first gene, recessive TuMV resistance 01 (retr01), had a recessive allele for resistance, was located on the upper portion of chromosome R4 and was epistatic to the second gene. The second gene, Conditional TuMV resistance 01 (ConTR01), possessed a dominant allele for resistance and was located on the upper portion of chromosome R8. These genes also controlled resistance to TuMV isolate CZE 1 and might be sufficient to explain the broad-spectrum resistance of RLR22. The dominant resistance gene, ConTR01, was coincident with one of the three eukaryotic initiation factor 4E (eIF4E) loci of B. rapa and possibly one of the loci of eIF(iso)4E. The recessive resistance gene retr01 was apparently coincident with one of the three loci of eIF(iso)4E in the A genome of Brassica napus and therefore, by inference, in the B. rapa genome. This suggested a mode of action for the resistance that is based on denying the viral RNA access to the translation initiation complex of the plant host. The gene retr01 is the first reported example of a recessive resistance gene mapped in a Brassica species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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