Evaluation of Polymorphic Splicing in the Mechanism of the Association of the Insulin Gene With Diabetes
Notice bibliographique
Résumé
The association of type 1 diabetes with the insulin gene (IDDM2 locus) has been mapped to a short haplotype encompassing two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in perfect linkage disequilibrium (r(2) = 1) with each other and with the two allele classes at the variable number of tandem repeats (VNTR) polymorphism upstream of the transcription site. Although it is believed that the genetic effect is mediated through transcriptional effects of the VNTR, an alternative mechanism has been recently proposed: In transfected cells, the common A allele at one of the SNPs (-23A-->T, in relation to the translation-initiation codon) weakens the splicing of intron 1, resulting in a minor ( approximately 15% of total RNA) transcript with a longer 5' untranslated region and sixfold enhanced translational efficiency. The purpose of our study was to confirm these findings in RNA from normal human pancreas and thymus. We report that pancreas does contain the alternative transcript in an allele-dependent manner but at a very low proportion (<5% of total INS mRNA). We believe that this level would have a minor, if any, biological effect involved in the mechanism of the IDDM2 locus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».