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Enregistrement W2118831378 · doi:10.1136/gutjnl-2012-302514d.4

PWE-004 A study of faecal volatile organic compounds metabolome in healthy population across the countries

2012· article· en· W2118831378 sur OpenAlexaffabout
Ishfaq Ahmed, Vicky De Preter, Kevin P. Rioux, Norman Ratcliffe, C Probert

Notice bibliographique

RevueGut · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Chemical Sensor Technologies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPopulationFecesDiscriminant function analysisUrineMedicinePopulation studyUnivariate analysisMultivariate analysisBiologyInternal medicineEnvironmental healthEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Faecal biomarkers are emerging non-invasive tools for diagnosing gastrointestinal disorders. Faecal volatile organic compounds (VOCs) have been studied more recently in clinical diagnosis. Pattern of faecal VOCs in healthy population may provide basis for understanding changes in disease conditions. The VOCs within the metaboloms may be different across the countries due to differences in dietary habits and environmental conditions and may have implications in developing their clinical utility. Methods We aim to study the faecal VOCs of the healthy population from three different countries that is, England, Belgium and Canada. A total of 159 health volunteers (English=109, F=69), (Belgium=20, F=14), (Canada=30, F=17) donated faecal samples. Fresh samples were aliquoted in 18 mls sealed vials. VOCs were extracted using solid phase micro extraction and were analysed using gas chromatography–mass spectrometery. VOCs were identified using NIST library search comparing their fragment pattern. Results A total of 232 VOCs were identified. Using binary data (presence or absence of VOCs), univariate analysis was used to identify those VOCs which were statistically significant (p<0.05) in discerning differences between the three population groups. Alcohols, ketones and esters were predominantly associated with English volunteers compared to both Canadian and Belgium volunteers while aldehydes and alkenes were predominantly detected VOCs in the Canadian and Belgium groups respectively. A multivariate discriminant function analysis utilising these VOCs was able to differentiate three groups with a sensitivity of 96% and specificity of 90%. Conclusion The observed differences in the faecal VOCs metabolites of the healthy population in different countries may provide important basis in the clinical utility of faecal biomarkers. It may also provide information in studying the differences in disease prevalence and behaviour in different countries. Further studies are warranted to explore this area. Competing interests None declared. References 1. Probert CS , Ahmed I, Khalid T, et al. Volatile organic compounds as diagnostic biomarkers in gastrointestinal and liver diseases. J Gastrointestin Liver Dis 2009; 18 :337–43. 2. Angriman I , Scarpa M, D'Incà R, et al. Enzymes in feces: useful markers of chronic inflammatory bowel disease. Clin Chim Acta 2007; 381 :63–8.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,302

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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