FDJS03 Isolates Causing an Outbreak of Aseptic Meningitis in China That Evolved from a Distinct Echovirus 30 Lineage Imported from Countries of the Commonwealth of Independent States
Notice bibliographique
Résumé
We compared echovirus 30 strains (FDJS03) which caused an outbreak of aseptic meningitis in China in 2003 with other human enterovirus B strains. Sequencing of the complete genome of FDJS03_84, a representative strain from this outbreak, revealed a mosaic structure with a putative recombination spot within the 2B gene. It was most similar to a strain of the same serotype, E30-14125-00, in the 5' half of the genome but was almost equidistant to all strains analyzed in most of the 3' half of the genome. Phylogenetic relationships in the 5'-untranslated region and the VP1 gene indicated that the FDJS03 isolates were closely related to a distinct lineage of E30 which circulated in countries of the Commonwealth of Independent States during 1999 and 2000. It is most likely that the ancestor of FDJS03 isolates experienced multiple recombination events in the nonstructural protein coding region, which were partly observed in the phylogenetic analysis of the 3D region.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».