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Enregistrement W2118961010 · doi:10.1021/bi012038+

Proximity of the Protein Moiety of a GPI-Anchored Protein to the Membrane Surface:  A FRET Study

2002· article· en· W2118961010 sur OpenAlexaff
Marty T. Lehto, Frances J. Sharom

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFörster resonance energy transferLipid bilayerChemistryBilayerPlacental alkaline phosphataseBiophysicsMembraneVesicleMembrane proteinProtein–lipid interactionBiochemistryMoietyFluorescenceAlkaline phosphataseEnzymeIntegral membrane proteinStereochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

GPI-anchored proteins are ubiquitous on the eukaryotic cell surface, where they are involved in a variety of functions ranging from adhesion to enzymatic catalysis. Indirect evidence suggests that the GPI anchor may hold the protein close to the plasma membrane; however, there is a lack of direct information on the proximity of the protein portion of GPI-anchored proteins to the bilayer surface. The present study uses fluorescence resonance energy transfer (FRET) to address this important problem. The GPI-anchored ectoenzyme placental alkaline phosphatase (PLAP) was purified from a plasma membrane extract of human placental microsomes without the use of butanol. The protein was fluorescently labeled at the N-terminus with 7-(dimethylamino)coumarin-4-acetic acid succinimidyl ester (DMACA-SE) or Oregon Green 488 succinimidyl ester (OG488-SE), and each was reconstituted by detergent dilution into defined lipid bilayer vesicles containing an increasing mole fraction of a fluorescent lipid probe. The fluorescence of the labeled PLAP donors was quenched in a concentration-dependent manner by the lipid acceptors. The energy transfer data were analyzed using an approach that describes FRET between a uniform distribution of donors and acceptors in an infinite plane. The distance of closest approach between the protein moiety of PLAP and the lipid-water interfacial region of the bilayer was estimated to be smaller than 10-14 A. This indicates that the protein portion of PLAP is located very close to the lipid bilayer, possibly resting on the surface. This contact may allow transmission of structural changes from the membrane surface to the protein, which could influence the behavior and catalytic properties of GPI-anchored proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,502

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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