Preliminary Study on Differentiation of <i>Leptospira Grippotyphosa</i> and <i>Leptospira Sejroe</i> from Other Common Pathogenic Leptospiral Serovars in Canine Urine by Polymerase Chain Reaction Assay
Notice bibliographique
Résumé
A multiplex polymerase chain reaction (PCR) method using primer sets of G1/G2 and B64-I/B64-II was validated to detect pathogenic leptospira serovars from canine urine samples. The PCR method was found to be specific and sensitive with a detection limit of 100 cells of Leptospira icterohaemorrhagiae per milliliter of urine. The primer set previously designated and erroneously transcribed B64-I/B64-II amplified a DNA fragment of 352 base pairs from Leptospira grippotyphosa and Leptospira sejroe but not from Leptospira autumnalis, Leptospira bratislava, Leptospira canicola, Leptospira hardjo, Leptospira icterohaemorrhagiae, and Leptospira pomona. From 100 diagnostic canine urine samples, 5 were found positive for Leptospira grippotyphosalsejroe with a PCR product of 352 base pairs and 6 were positive for other pathogenic leptospira serovars with a PCR product of 285 base pairs. One 285-base pair product was sequenced and found to be 99.3% homologous to the G1/G2 PCR fragment sequence reported previously. All 352-base pair PCR products of clinical samples and pure cultures of L. grippotyphosa and L. sejroe were sequenced. The 352-base pair fragment sequences of L. grippotyphosa and L sejroe were identical. Only 2 base pairs were found different between the sequences from pure cultures and those from clinical samples. Serum samples from 3 positive cases that generated a PCR product of 352 base pairs were tested by the microscopic agglutination test, and 2 were found to be positive for L. grippotyphosa (1:10,240 and 1:5,120), 1 was positive for L. grippotyphosa (1:320) or L. icterohaemorrhagiae (1:320). The results of this study suggest that the multiplex PCR with the primer set G1/G2 and the erroneously transcribed B64-I/B64-II may be able to differentiate L. grippotyphosa or L. sejroe from other pathogenic leptospira serovars commonly tested for in Canadian diagnostic laboratories.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».