MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2119672300 · doi:10.1094/pdis.2004.88.5.575a

First Report of <i>Strawberry latent ringspot virus</i> in Strawberry in the United States and Canada

2004· article· en· W2119672300 sur OpenAlexaboutno aff
Robert R. Martín, Ioannis E. Tzanetakis, Janelle E. Barnes, Janice F. Elmhirst

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFragariaBiologyGenBankChenopodium quinoaPlant virusVirusChenopodiumBotanyVirologyHorticultureWeedGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Strawberries in southern California have shown decline symptoms during the last 2 years. More than 70% of plants tested in California were infected with two newly identified criniviruses that infect strawberry (Strawberry pallidosis and Beet pseudo-yellows). Strawberry cultivars are usually symptomless when infected with one virus, and testing for other strawberry viruses is performed to identify any other viruses that may be involved in the symptomatology. Primers SLRSV F (5' CCTCTCCAACC-TGCTAGACT 3') and SLRSV R (5' AAGCGCATGAAGGTGTAACT 3') that amplify a 497-bp fragment of RNA 2 of Strawberry latent ringspot virus (SLRSV) were developed and utilized for reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) detection. SLRSV belongs to the family Sequiviridae and is transmitted by nematodes of the genus Xiphinema. The virus has a broad host range (4) and is usually symptomless in strawberries. Strawberry plants from commercial fields in California, Oregon, Washington, and British Columbia, Canada were tested. SLRSV was identified in 17% of plants tested from California and 4% of plants tested from British Columbia, while all samples from Oregon and Washington tested negative. The fragment amplified (GenBank Accession No. AY461735, isolate from British Columbia, Canada) shares 84% nucleotide and 94% amino acid sequence identity with the previously published sequence of SLRSV from strawberry (GenBank Accession No. X77466) (3). The virus was transmitted mechanically from strawberry samples from Canada to Chenopodium quinoa, and the infected C. quinoa plants tested positive for SLRSV with RT-PCR, while no amplicons were obtained from noninoculated control plants. To our knowledge, this is the first report of SLRSV in strawberry in North America, although it has been previously reported in a single cherry tree in Ontario, Canada (1) and in an imported seed lot of parsley in California (2). The number of plants that tested positive as well as the geographic distribution of the virus indicates that the virus is widespread in California, but further testing is needed to identify its distribution in other states. References: (1) W. R. Allen et al. Phytopathology 60:1262, 1970. (2) C. M. Hanson and R. N. Campbell. Plant Dis. Rep. 63:142, 1979. (3) S. Kreiah et al. J. Gen. Virol. 75:2527, 1994. (4) K. Schmelzer. Phytopath. Z. 66:1, 1969.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,105
Score d'incertitude au seuil0,142

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePlant DiseaseMême sujetPlant Virus Research StudiesTravaux en français237 207