The Protein Interaction Network of the Human Transcription Machinery Reveals a Role for the Conserved GTPase RPAP4/GPN1 and Microtubule Assembly in Nuclear Import and Biogenesis of RNA Polymerase II
Notice bibliographique
Résumé
RNA polymerase II (RNAPII), the 12-subunit enzyme that synthesizes all mRNAs and several non-coding RNAs in eukaryotes, plays a central role in cell function. Although multiple proteins are known to regulate the activity of RNAPII during transcription, little is known about the machinery that controls the fate of the enzyme before or after transcription. We used systematic protein affinity purification coupled to mass spectrometry (AP-MS) to characterize the high resolution network of protein interactions of RNAPII in the soluble fraction of human cell extracts. Our analysis revealed that many components of this network participate in RNAPII biogenesis. We show here that RNAPII-associated protein 4 (RPAP4/GPN1) shuttles between the nucleus and the cytoplasm and regulates nuclear import of POLR2A/RPB1 and POLR2B/RPB2, the two largest subunits of RNAPII. RPAP4/GPN1 is a member of a newly discovered GTPase family that contains a unique and highly conserved GPN loop motif that we show is essential, in conjunction with its GTP-binding motifs, for nuclear localization of POLR2A/RPB1 in a process that also requires microtubule assembly. A model for RNAPII biogenesis is presented.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».