MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2120298753 · doi:10.1093/brain/awv080

Multiple sclerosis-associated CLEC16A controls HLA class II expression via late endosome biogenesis

2015· article· en· W2120298753 sur OpenAlexafffund
Marvin M. van Luijn, Karim L. Kreft, Marlieke L.M. Jongsma, Steven W. Mes, Annet F. Wierenga‐Wolf, Marjan van Meurs, Marie‐José Melief, Rik van der Kant, Lennert Janssen, Hans Janssen, Rusung Tan, John J. Priatel, Jacques Neefjes, Jon D. Laman, Rogier Q. Hintzen

Notice bibliographique

RevueBrain · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchStichting ZabawasChild and Family Research Institute
Mots-clésAntigenImmunologyMultiple sclerosisCIITABiologyPeripheral blood mononuclear cellHuman leukocyte antigenEndosomeImmune systemCell biologyMedicineMHC class IIGeneticsMajor histocompatibility complexIn vitroIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

C-type lectins are key players in immune regulation by driving distinct functions of antigen-presenting cells. The C-type lectin CLEC16A gene is located at 16p13, a susceptibility locus for several autoimmune diseases, including multiple sclerosis. However, the function of this gene and its potential contribution to these diseases in humans are poorly understood. In this study, we found a strong upregulation of CLEC16A expression in the white matter of multiple sclerosis patients (n = 14) compared to non-demented controls (n = 11), mainly in perivascular leukocyte infiltrates. Moreover, CLEC16A levels were significantly enhanced in peripheral blood mononuclear cells of multiple sclerosis patients (n = 69) versus healthy controls (n = 46). In peripheral blood mononuclear cells, CLEC16A was most abundant in monocyte-derived dendritic cells, in which it strongly co-localized with human leukocyte antigen class II. Treatment of these professional antigen-presenting cells with vitamin D, a key protective environmental factor in multiple sclerosis, downmodulated CLEC16A in parallel with human leukocyte antigen class II. Knockdown of CLEC16A in distinct types of model and primary antigen-presenting cells resulted in severely impaired cytoplasmic distribution and formation of human leucocyte antigen class II-positive late endosomes, as determined by immunofluorescence and electron microscopy. Mechanistically, CLEC16A participated in the molecular machinery of human leukocyte antigen class II-positive late endosome formation and trafficking to perinuclear regions, involving the dynein motor complex. By performing co-immunoprecipitations, we found that CLEC16A directly binds to two critical members of this complex, RILP and the HOPS complex. CLEC16A silencing in antigen-presenting cells disturbed RILP-mediated recruitment of human leukocyte antigen class II-positive late endosomes to perinuclear regions. Together, we identify CLEC16A as a pivotal gene in multiple sclerosis that serves as a direct regulator of the human leukocyte antigen class II pathway in antigen-presenting cells. These findings are a first step in coupling multiple sclerosis-associated genes to the regulation of the strongest genetic factor in multiple sclerosis, human leukocyte antigen class II.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBrainMême sujetT-cell and B-cell ImmunologyTravaux en français237 207