The changing prevalence of drug-resistant <i>Escherichia coli</i> clonal groups in a community: evidence for community outbreaks of urinary tract infections
Notice bibliographique
Résumé
A multidrug-resistant clonal group (CgA) of Escherichia coli was shown to cause half of all trimethoprim-sulphamethoxazole (TMP-SMZ)-resistant urinary tract infections (UTIs) in a college community between October 1999 and January 2000. This second study was conducted to determine the fate of CgA. Urine E. coli isolates from women with UTI, collected between October 2000 and January 2001, were tested for antibiotic susceptibility, O serogroup, ERIC2 PCR and DNA macrorestriction patterns using pulsed-field gel electrophoresis. The proportion of UTIs caused by CgA declined by 38% (P<0.001) but the prevalence of resistance to TMP-SMZ did not change. Six additional clonal groups were identified and these were responsible for 32% of TMP-SMZ-resistant UTIs. The temporal decline in the proportion of UTIs caused by CgA provides evidence that CgA caused a community outbreak of UTI. The fluctuation and occurrence of other E. coli clonal groups in this community suggest that a proportion of community-acquired UTIs may be caused by E. coli disseminated from one or more point sources.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».