MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2121383084 · doi:10.1161/01.res.88.2.223

Functional Alterations of the <i>Nppa</i> Promoter Are Linked to Cardiac Ventricular Hypertrophy in WKY/WKHA Rat Crosses

2001· article· en· W2121383084 sur OpenAlexafffund
Christian F. Deschepper, Sandro Masciotra, Ahmad Zahabi, Isabelle Boutin-Ganache, Sylvie Picard, Timothy L. Reudelhuber

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council Canada
Mots-clésQuantitative trait locusInternal medicineLeft ventricular hypertrophyVentricleBiologyEndocrinologyLocus (genetics)Single-nucleotide polymorphismMuscle hypertrophyAtrial natriuretic peptideGeneticsGeneBlood pressureGenotypeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiac left ventricular hypertrophy (LVH) is commonly associated with hypertension, but its variance is determined for more than 50% by blood pressure-independent genetic factors. Because it constitutes one of the most important risk factors for cardiovascular mortality, we have performed a genome-wide scan of the F2 progeny of crosses between inbred WKY and WKHA rats to detect quantitative trait loci (QTL) linked to cardiac mass. In addition to left ventricular mass (LVM), we also measured left ventricle (LV) concentration of atrial natriuretic factor (ANF), because we have previously established that there was a genetic link between these 2 traits in the same animal cross. We found 2 contiguous QTL on chromosome 5 that were linked to either LVM (logarithm of odds [LOD]=3.5) or log(n) (LV ANF) (LOD=12). The 1-LOD support intervals of both QTL shared a region overlapping the locus of natriuretic peptide precursor A (NPPA:) (ie, the ANF-coding gene). We found by sequencing 2 single nucleotide polymorphisms (SNPs) within the first 650 bp of the NPPA: minimal promoters of the genes from both strains. One of these SNPs increased the transcriptional activity of the NPPA: minimal promoter in transfected neonatal cardiomyocytes in keeping with the higher LV concentration of ANF observed in WKY versus WKHA rats. Taken together with the previous reports showing that ANF may protect cardiomyocytes against hypertrophy, our genetic data single out NPPA: as a strong candidate gene for the determination of LVM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,642
Score d'incertitude au seuil0,299

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCirculation ResearchMême sujetProtein Kinase Regulation and GTPase SignalingTravaux en français237 207