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Enregistrement W2121564154 · doi:10.1086/507313

Immunogenetics of CD4 Lymphocyte Count Recovery during Antiretroviral Therapy: An AIDS Clinical Trials Group Study

2006· article· en· W2121564154 sur OpenAlexfundno aff
David W. Haas, Daniel E. Geraghty, Janet Andersen, Jessica C. Mar, Alison A. Motsinger‐Reif, Richard T. D’Aquila, Derya Unutmaz, Constance A. Benson, Marylyn D. Ritchie, Alan Landay

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversity of California, San DiegoUniversity of North Carolina at Chapel HillU.S. Public Health ServiceUniversity of California, Los AngelesBavarian NordicOhio State UniversityRush UniversityGeorgetown UniversityUniversity of CincinnatiUniversity of PittsburghUniversity of WashingtonCase Western Reserve UniversityMassachusetts General HospitalUniversity of MinnesotaHarvard UniversityUniversity of RochesterUniversity of MiamiNorthwestern UniversityYork UniversityBristol-Myers SquibbUniversity of PennsylvaniaGilead SciencesVanderbilt UniversityACT GovernmentUniversity of Southern CaliforniaGlaxoSmithKlineEmory UniversityAbbott Laboratories
Mots-clésImmunologyMultifactor dimensionality reductionLymphocyteViremiaBiologyViral loadTumor necrosis factor alphaImmune systemGenotypeSingle-nucleotide polymorphismGeneOncologyMedicineAntibodyGeneticsVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During antiretroviral therapy, CD4 lymphocyte count increases are modest in some patients despite virologic control. We explored whether polymorphisms in genes important for T cell expansion, survival, and apoptosis are associated with the magnitude of CD4 lymphocyte count recovery during antiretroviral therapy. We studied treatment-naive individuals who achieved sustained control of plasma viremia (<400 HIV-1 RNA copies/mL) for at least 48 weeks after initiation of antiretroviral therapy and compared genotypes among individuals who had an increase of either <200 or > or =200 CD4 cells/mm3 from baseline. A total of 137 single-nucleotide polymorphisms across 17 genes were characterized in 873 study participants. In multivariate analyses that controlled for clinical variables, polymorphisms in genes encoding tumor necrosis factor (TNF)-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL), TNF- alpha , Bcl-2-interacting molecule (Bim), interleukin (IL)-15, and IL-15 receptor alpha chain (IL-15R alpha ) were associated with the magnitude of the increase in CD4 lymphocyte count, as were haplotypes in genes encoding interferon- alpha , IL-2, and IL-15R alpha (P < .05, for each). Multifactor dimensionality reduction identified a gene-gene interaction between IL-2/IL-15 receptor common beta chain and IL-2/IL-7/IL-15 receptor common gamma chain. Immune recovery during antiretroviral therapy is a complex phenotype that is influenced by multiple genetic variants. Future studies should validate these tentative associations and define underlying mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,429
Score d'incertitude au seuil0,460

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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