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Enregistrement W2121902159 · doi:10.1091/mbc.e09-01-0062

Conformational Maturation and Post-ER Multisubunit Assembly of Gap Junction Proteins

2009· article· en· W2121902159 sur OpenAlexaff
Judy K. VanSlyke, Christian C. Naus, Linda S. Musil

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Eye InstituteNational Institutes of HealthUniversity of Pennsylvania
Mots-clésBiologyCell biologyConnexinProtein foldingOrganelleFolding (DSP implementation)ConnexonGap junctionGolgi apparatusBiophysicsEndoplasmic reticulumIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

For all previously well-characterized oligomeric integral membrane proteins, folding, multisubunit assembly, and recognition of conformationally immature molecules for degradation occurs at their organelle of synthesis. This cannot, however, be the case for the gap junction-forming protein connexin43 (Cx43), which when endogenously expressed undergoes multisubunit assembly into connexons only after its transport to the trans-Golgi network. We have developed two novel assays to assess Cx43 folding and assembly: acquisition of resistance of disulfide bonds to reduction by extracellularly added DTT and Triton X-114 detergent phase partitioning. We show that Cx43 synthesized at physiologically relevant levels undergoes a multistep conformational maturation process in which folding of connexin monomers within the ER is a prerequisite for multisubunit assembly in the TGN. Similar results were obtained with Cx32, disproving the widely reported contention that the site of endogenous beta connexin assembly is the ER. Exogenous overexpression of Cx43, Cx32, or Cx26 allows these events to take place within the ER, the first example of the TGN and ER as alternative sites for oligomeric assembly. Our findings also constitute the first biochemical evidence that defective connexin folding is a cause of the human disorder X-linked Charcot-Marie-Tooth disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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