Conservation of RNA chaperone activity of the human La-related proteins 4, 6 and 7
Notice bibliographique
Résumé
The La module is a conserved tandem arrangement of a La motif and RNA recognition motif whose function has been best characterized in genuine La proteins. The best-characterized substrates of La proteins are pre-tRNAs, and previous work using tRNA mediated suppression in Schizosaccharomyces pombe has demonstrated that yeast and human La enhance the maturation of these using two distinguishable activities: UUU-3'OH-dependent trailer binding/protection and a UUU-3'OH independent activity related to RNA chaperone function. The La module has also been identified in several conserved families of La-related proteins (LARPs) that engage other RNAs, but their mode of RNA binding and function(s) are not well understood. We demonstrate that the La modules of the human LARPs 4, 6 and 7 are also active in tRNA-mediated suppression, even in the absence of stable UUU-3'OH trailer protection. Rather, the capacity of these to enhance pre-tRNA maturation is associated with RNA chaperone function, which we demonstrate to be a conserved activity for each hLARP in vitro. Our work reveals insight into the mechanisms by which La module containing proteins discriminate RNA targets and demonstrates that RNA chaperone activity is a conserved function across representative members of the La motif-containing superfamily.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».