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Enregistrement W2122817117 · doi:10.1128/ec.00385-05

Transcript Profiles of <i>Candida albicans</i> Cortical Actin Patch Mutants Reflect Their Cellular Defects: Contribution of the Hog1p and Mkc1p Signaling Pathways

2006· article· en· W2122817117 sur OpenAlexafffund
Ursula Oberholzer, André Nantel, Judith Berman, Malcolm Whiteway

Notice bibliographique

RevueEukaryotic Cell · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyCell biologyEndocytosisMutantActinCytochalasin DGreen fluorescent proteinOsmotic shockCandida albicansSignal transductionCytoskeletonGeneCellBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In Candida albicans, Myo5p and Sla2p are required for the polarized localization and function of cortical actin patches, for hyphal formation, and for endocytosis. Deletion of either the MYO5 or the SLA2 gene generated a common transcriptional response that involved changes in the transcript levels of cell wall protein- and membrane protein-encoding genes. However, these profiles were distinct from those observed for a mutant with specific deletions of the actin-organizing domains of Myo5p or for wild-type cells treated with cytochalasin A, both of which also generate defects in the organization of cortical actin patches. The profiles observed for the myo5Delta and sla2Delta mutants had similarities to those of wild-type cells subjected to an osmotic shock, and the defects in cortical patch function found with myo5Delta and sla2Delta mutants, but not cortical actin patch distribution per se, affected sensitivity to various stresses, including heat and osmotic shocks and cell wall damage. Secondary effects coupled with defective endocytosis, such as lack of polarized lipid rafts and associated protein Rvs167-GFP (where GFP is green fluorescent protein) and lack of polarized wall remodeling protein GFP-Gsc1, were also observed for the myo5Delta and sla2Delta mutants. The mitogen-activated protein kinases Hog1p and Mkc1p, which mediate signaling in response to osmotic stress and cell wall damage, do not play a major role in regulating the transcript level changes in the myo5Delta and sla2Delta mutants. Hog1p was not hyperphosphorylated in the myo5Delta and sla2Delta mutants, and the transcript levels of only a subset of genes affected in the myo5Delta mutant were dependent upon the presence of Hog1p and Mkc1p. However, it appears that Hog1p and Mkc1p play important roles in the myo5Delta mutant cells because double deletion of myosin I and either Hog1p or Mkc1p resulted in very-slow-growing cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,519

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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