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Enregistrement W2123120476

The Role of Sulfur Metabolism in Effective Plant-Microbe Interactions

2015· article· en· W2123120476 sur OpenAlexfundno aff
Justin Joseph Speck

Notice bibliographique

RevueUWM Digital Commons (University of Wisconsin–Milwaukee) · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNitrogen and Sulfur Effects on Brassica
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcMaster UniversityUniversity of MinnesotaU.S. Department of Agriculture
Mots-clésSulfur metabolismPlant metabolismSulfurChemistryMetabolismBiologyComputer scienceBiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bradyrhizobium japonicum USDA110 and Sinorhizobium meliloti RM1021 are nitrogen fixing rhizobia that fix nitrogen when in a symbiotic relationship with legumes. For effective nitrogen-fixing symbiosis to occur these rhizobia must differentiate into nitrogen-fixing bacteroids. This involves the production of high levels of sulfur rich nitrogenase as well as other sulfur containing compounds, creating a large demand for sulfur. This work examined the role of organic sulfur in the establishment of symbiosis and viability of rhizobia in plant nodules.\nDisruption of the sulfonate sulfur utilization gene ssuD in both Bradyrhizobium japonicum USDA110 and Sinorhizobium meliloti RM1021 resulted in a strong nitrogen deficient phenotype in the host plants. This phenotype was linked to a reduced ability to invade host plants as a result of increased sensitivity to oxidative stress. Additionally, once inside the plant nodules, the ssuD mutants were slow to grow with no observable nitrogen fixation occurring. However, the ability of ssuD mutants to continue to grow at slow rates in nodules resulted in the discovery that sulfate esters are another important sulfur source during symbiosis.\nDickeya dadantii 3937 is a phytopathogen, which causes disease in potato, maize, banana, and pineapple as well as ornamental house plants and a wide range of subtropical and tropical plants. D. dadantii has been used as a model organism for the study of secretion systems and virulence factors in phytopathogens. This work examined the regulation, induction, and role of organic and inorganic sulfur utilization genes during the infection of potato by D. dadantii.\nThe regulation of sulfur metabolism in D. dadantii was determined to be similar to the model organism Escherichia coli. However, disruption of the arylsulfatase operon slowed the spread of maceration in potato infections despite D. dadantii being unable to grow on arylsulfonates. Examination of the arylsulfatase operon resulted in the discovery of a phenol dependent sulfotransferase that was able to sulfonate salicylic acid and is hypothesized to play a role in subverting salicylic acid induced immunity in host plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,312
Score d'incertitude au seuil0,592

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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