MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2123197724 · doi:10.1096/fj.10-171959

Fine‐tuning the stimulation of MLL1 methyltransferase activity by a histone H3‐based peptide mimetic

2010· article· en· W2123197724 sur OpenAlexafffund
Vanja Avdic, Pamela Zhang, Sylvain Lanouette, Anastassia Voronova, Ilona S. Skerjanc, J.-F. Couture

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésHistone H3Histone methyltransferaseMethyltransferaseMethylationAcetylationMoietyHistone methylationHistoneChemistryPeptideEpigeneticsBiochemistryCell biologyBiologyStereochemistryDNA methylationGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The SETI family of methyltransferases carries out the bulk of histone H3 Lys‐4 methylation in vivo. One of the common features of this family is the regulation of their methyltransferase activity by a tripartite complex composed of WDR5, RbBP5, and Ash2L. To selectively probe the role of the SET1 family of methyltransferases, we have developed a library of histone H3 peptide mimetics and report herein the characterization of an Nα acetylated form of histone H3 peptide (NαH3). Binding and inhibition studies reveal that the addition of an acetyl moiety to the N terminus of histone H3 significantly enhances its binding to WDR5 and prevents the stimulation of MLL1 methyltransferase activity by the WDR5‐RbBP5‐Ash2L complex. The crystal structure of NαH3 in complex with WDR5 reveals that a high‐affinity hydrophobic pocket accommodates the binding of the acetyl moiety. These results provide the structural basis to control WDR5‐RbBP5‐Ash2L‐MLL1 activity and a tool to manipulate stem cell differentiation programs.—Avdic, V., Zhang, P., Lanouette, S., Voronova, A., Skerjanc, I., Couture, J.‐F. Fine‐tuning the stimulation of MLL1 methyltransferase activity by a histone H3‐based peptide mimetic. FASEB J. 25, 960–967 (2011). www.fasebj.org

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,291

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB JournalMême sujetEpigenetics and DNA MethylationTravaux en français237 207