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Enregistrement W2123255635 · doi:10.1111/j.1744-7917.2009.01275.x

Cloning, expression and localization of a trypsin‐like serine protease in the spruce budworm, <i>Choristoneura fumiferana</i>

2009· article· en· W2123255635 sur OpenAlexafffund
Wenying He, Yiping Zheng, Lin Tang, Catherine Béliveau, Daniel Doucet, Michel Cusson

Notice bibliographique

RevueInsect Science · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensCanadian Forest ServiceOntario Forest Research Institute
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Guangdong ProvinceOntario GenomicsOntario Genomics InstituteGenome Canada
Mots-clésBiologySerine proteaseTrypsinHemolymphMolecular biologyComplementary DNASpruce budwormSerineBiochemistryChoristoneura fumiferanaProteasecDNA libraryEnzymeGeneBotanyTortricidae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A trypsin‐like molting‐related serine protease cDNA ( Cf MRSP) was cloned from the spruce budworm, Choristoneura fumiferana . The full‐length Cf MRSP complementary DNA (cDNA) encoded a 43 kDa protein that contained a trypsin‐like serine protease catalytic domain, but no clip domain. The C‐terminal extension contained five cystein residues, which may allow the protein to form a homodimer through interchain disulfide bonds and regulate the activity of Cf MRSP. Phylogenetic tree analysis showed that Cf MRSP clusters with lepidopteran homologues such as serine protease 1 of Lonomia obliqua , hemolymph proteinase 20 (HP20), pattern recognition serine proteinase precursor (ProHP14) and a trypsin‐like protein of Manduca sexta . Northern blot analysis of developmental expression of Cf MRSP indicated that its transcripts were found primarily in the epidermis and were produced during all of the tested stadia, from 4th instar larvae to pupae, but increased levels of Cf MRSP transcripts were always found after each molt. A high level of the protein was found in the epidermis by immunohistochemistry analysis. Altogether these data suggest that Cf MRSP plays a role in the epidermis during molting and metamorphosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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