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Enregistrement W2123348489 · doi:10.1128/jb.188.3.1011-1021.2006

Native Cell Wall Organization Shown by Cryo-Electron Microscopy Confirms the Existence of a Periplasmic Space in <i>Staphylococcus aureus</i>

2006· article· en· W2123348489 sur OpenAlexafffund
Valério R. F. Matias, Terry J. Beveridge

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Mots-clésCell wallPeriplasmic spaceTeichoic acidVesicleUltrastructureMembraneBiophysicsElectron microscopeCell envelopeBiologyTransmission electron microscopyCell membraneBacterial outer membranePeptidoglycanLysisMaterials scienceAnatomyBiochemistryNanotechnologyEscherichia coliOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The current perception of the ultrastructure of gram-positive cell envelopes relies mainly on electron microscopy of thin sections and on sample preparation. Freezing of cells into a matrix of amorphous ice (i.e., vitrification) results in optimal specimen preservation and allows the observation of cell envelope boundary layers in their (frozen) hydrated state. In this report, cryo-transmission electron microscopy of frozen-hydrated sections of Staphylococcus aureus D2C was used to examine cell envelope organization. A bipartite wall was positioned above the plasma membrane and consisted of a 16-nm low-density inner wall zone (IWZ), followed by a 19-nm high-density outer wall zone (OWZ). Observation of plasmolyzed cells, which were used to artificially separate the membrane from the wall, showed membrane vesicles within the space associated with the IWZ in native cells and a large gap between the membrane and OWZ, suggesting that the IWZ was devoid of a cross-linked polymeric cell wall network. Isolated wall fragments possessed only one zone of high density, with a constant level of density throughout their thickness, as was previously seen with the OWZs of intact cells. These results strongly indicate that the IWZ represents a periplasmic space, composed mostly of soluble low-density constituents confined between the plasma membrane and OWZ, and that the OWZ represents the peptidoglycan-teichoic acid cell wall network with its associated proteins. Cell wall differentiation was also seen at the septum of dividing cells. Here, two high-density zones were sandwiched between three low-density zones. It appeared that the septum consisted of an extension of the IWZ and OWZ from the outside peripheral wall, plus a low-density middle zone that separated adjacent septal cross walls, which could contribute to cell separation during division.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations215
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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