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Enregistrement W2123500228 · doi:10.5897/jmgg.9000024

HLA-DQA1 genotyping of Helicobacter pylori associated gastritis patients

2011· article· en· W2123500228 sur OpenAlexaboutno aff
Nibras S. Al-Ammar, Ihsan Edan Alsaimary, Saad Sh. Hamadi, Ma Luo, Trevor Peterson, Chris Czarnecki

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics and Genomics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypingHelicobacter pyloriGastritisOdds ratioHuman leukocyte antigenInternal medicineMedicineGastroenterologyGenotypeAlleleLocus (genetics)Chronic gastritisImmunologyBiologyGeneticsGeneAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To study HLA-DQA1 genotyping in Helicobacter pylori associated gastritis patients. This study was carried out in College of Medicine, University of Basrah. HLA-DQA1 genotyping was done in College of Medicine, University of Manitoba, Winnipeg, Canada during the period from 17th of April 2009 to 15th of July 2010. A total of 100 patients (41 males and 59 females and a total of 30 controls (18 males and 12 females) were included in this study. DQA1 alleles frequencies were studied in 70H. pylori associated gastritis patients and 30 healthy controls. DQA1*0201 decreased allele frequency was statistically not significant in H. pylori associated gastritis patients, but there was a strong association (odds ratio= 2.61(, as compared with controls. In the present study many alleles from both locus showed high frequencies with a very strong association, but statistically not significant, this association has not been reported and it is important to note that a larger sample size should be studied.   Key words: HLA-DQA1 genotyping, DQA1*0201, Helicobacter

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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