A Simple Screening Approach to Reduce B*5701-Associated Abacavir Hypersensitivity on the Basis of Sequence Variation in HIV Reverse Transcriptase
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Abacavir hypersensitivity is strongly associated with the human leukocyte antigen (HLA)-B*5701 allele; however, the cost of routine high-resolution HLA typing before initiation of therapy remains prohibitive. We propose a simple approach to reduce B*5701-associated abacavir hypersensitivity based on the screening of human immunodeficiency virus (HIV) reverse transcriptase (RT) for a signature B*5701-associated cytotoxic T lymphocyte escape mutation at RT codon 245. METHODS: The correlation between HLA-B*5701 and RT codon 245 variation was investigated in 392 HIV-infected, antiretroviral-naive adults who were initiating highly active antiretroviral therapy. The relationship between codon 245 variation and premature abacavir discontinuation was investigated in a larger cohort of treated individuals (n=982). Associations between HLA-B*5701 and codon 245 variants were determined using Fisher's exact test or the chi (2) test. RESULTS: A very strong association between HLA-B*5701 and RT codon 245 variation was observed. Only 1 (4.2%) of 24 subjects with B*5701 harbored virus with the clade B "wild-type" amino acid 245V, compared with 278 (75.5%) of 368 who did not have B*5701 (P<.001). The sensitivity and specificity of codon 245 substitutions for predicting HLA-B*5701 were 96% and 75%, respectively, and the positive and negative predictive values were 20% and 99.6%, respectively. This association remained robust even after antiretroviral treatment was administered (negative predictive value, 100%; n=269). In abacavir-treated individuals (n=982), codon 245 substitutions were predictive of premature abacavir discontinuation (P=.02). CONCLUSIONS: As HIV RT sequence is incidentally obtained as a part of routine drug-resistance testing, the examination of sequence variation at RT codon 245 could be adopted as a simple, low-cost screening method to identify individuals who could be safely treated with abacavir and/or who could benefit from HLA characterization.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
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