Histone Recognition and Large-Scale Structural Analysis of the Human Bromodomain Family

2012· article· en· 1 752 citations· W2123647733 sur OpenAlex· 10.1016/j.cell.2012.02.013

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,013

Tête enseignante GPT0,248

Écart entre enseignants: 0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Bromodomains (BRDs) are protein interaction modules that specifically recognize ε-N-lysine acetylation motifs, a key event in the reading process of epigenetic marks. The 61 BRDs in the human genome cluster into eight families based on structure/sequence similarity. Here, we present 29 high-resolution crystal structures, covering all BRD families. Comprehensive crossfamily structural analysis identifies conserved and family-specific structural features that are necessary for specific acetylation-dependent substrate recognition. Screening of more than 30 representative BRDs against systematic histone-peptide arrays identifies new BRD substrates and reveals a strong influence of flanking posttranslational modifications, such as acetylation and phosphorylation, suggesting that BRDs recognize combinations of marks rather than singly acetylated sequences. We further uncovered a structural mechanism for the simultaneous binding and recognition of diverse diacetyl-containing peptides by BRD4. These data provide a foundation for structure-based drug design of specific inhibitors for this emerging target family.

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La notice

Revue: Cell
Thématique: Protein Degradation and Inhibitors
Domaine: Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens: Canada Research ChairsOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteStructural Genomics Consortium
Organismes subventionnaires: Canada Research ChairsCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaWellcome TrustGlaxoSmithKlineOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPfizerEli Lilly and Company
Mots-clés: BromodomainAcetylationBiologyBRD4HistoneComputational biologyGeneticsStructural similarityBET inhibitorEpigeneticsBiochemistryDNAGene
Résumé présent dans OpenAlex: oui
API: /api/v1/works/W2123647733