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Enregistrement W2123889466 · doi:10.1038/bjc.2012.160

Association of PHB 1630 C>T and MTHFR 677 C>T polymorphisms with breast and ovarian cancer risk in BRCA1/2 mutation carriers: results from a multicenter study

2012· article· en· W2123889466 sur OpenAlexafffund
Anna Jakubowska, Dominik Rozkrut, Antonis C. Antoniou, Ute Hamann, Rodney J. Scott, L McGuffog, S Healy, Olga M. Sinilnikova, Gad Rennert, Flavio Lejbkowicz, Anath Flugelman, Irene L. Andrulis, Gord Glendon, H Ozçelik, Mads Thomassen, M Paligo, Paolo Aretini, J Kantala, B Aroer, Anna von Wachenfeldt, Annelie Liljegren, Niklas Loman, Kenneth D. Herbst, Ulf Kristoffersson, Richard Rosenquist, Per Karlsson, Marie Stenmark‐Askmalm, Beatrice Melin, Katherine L. Nathanson, Susan M. Domchek, Tomasz Byrski, Tomasz Huzarski, Jacek Gronwald, Janusz Menkiszak, Cezary Cybulski, P. Sanchez-Serrano, Ana Osório, Teresa Ramóny Cajal, Marianthi Tsitlaidou, Javier Benı́tez, Michael Gilbert, Matti A. Rookus, Cora M. Aalfs, Irma Kluijt, J L Boessenkool-Pape, Hanne Meijers‐Heijboer, Jan C. Oosterwijk, Christi J. van Asperen, Marinus J. Blok, Marcel Nelen, A.M.W. van den Ouweland, Caroline Seynaeve, Rob B. van der Luijt, Peter Devilee, Douglas F. Easton, S. Peock, D Frost, Radka Platte, Steve D. Ellis, Elena Fineberg, D. Gareth Evans, Fiona Lalloo, Rosalind A. Eeles, Chris Jacobs, Julian Adlard, R. Davidson, Diana Eccles, T Cole, Jackie Cook, Andrew K. Godwin, Betsy Bove, Dominique Stoppa‐Lyonnet, Virginie Caux‐Moncoutier, Muriel Belotti, Carole Tirapo, Sylvie Mazoyer, Laure Barjhoux, Nadia Boutry‐Kryza, Pascal Pujol, Isabelle Coupier, JP Peyrat, Philippe Vennin, D Müller, J.-P. Fricker, Laurence Venat‐Bouvet, Oskar T. Johannsson, Claudine Isaacs, Rita K. Schmutzler, Barbara Wappenschmidt, A Meindl, Norbert Arnold, Raymonda Varon-Mateeva, Dieter Niederacher, Christian Sutter, Heidrun L. Deissler, Sabine Preisler-Adams, Jacques Simard, Penny Soucy, Francine Durocher, Georgia Chenevix‐Trench, Jonathan Beesley, X. Chen, Timothy R. Rebbeck, Fergus J. Couch, X. Wang, Noralane M. Lindor, Zachary Fredericksen, V. Shane Pankratz, Paolo Peterlongo, Bernardo Bonanni, Stefano Fortuzzi, Bernard Peissel, Csilla I. Szabo, P. L., Jennifer T. Loud, Jan Lubiński

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité LavalCancer Care OntarioCentre hospitalier universitaire de QuébecLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthSahlgrenska UniversitetssjukhusetCancer Care OntarioAkademiska SjukhusetOdense UniversitetshospitalMayo ClinicIstituto Toscano TumoriLunds UniversitetZonMwMinisterio de Ciencia e InnovaciónNational Institute for Health and Care ResearchUppsala UniversitetCancer AustraliaNational Health and Medical Research CouncilCancer Research UKUniversity of PennsylvaniaSusan G. KomenDeutsches KrebsforschungszentrumRoyal Marsden NHS Foundation TrustMedical Research CouncilBreast Cancer Research FoundationNational Breast Cancer Foundation
Mots-clésMethylenetetrahydrofolate reductaseOvarian cancerBreast cancerOncologyGenotypeMutationMedicineInternal medicineGeneticsCancer researchGynecologyBiologyCancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The variable penetrance of breast cancer in BRCA1/2 mutation carriers suggests that other genetic or environmental factors modify breast cancer risk. Two genes of special interest are prohibitin (PHB) and methylene-tetrahydrofolate reductase (MTHFR), both of which are important either directly or indirectly in maintaining genomic integrity. METHODS: To evaluate the potential role of genetic variants within PHB and MTHFR in breast and ovarian cancer risk, 4102 BRCA1 and 2093 BRCA2 mutation carriers, and 6211 BRCA1 and 2902 BRCA2 carriers from the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1 and BRCA2 (CIMBA) were genotyped for the PHB 1630 C>T (rs6917) polymorphism and the MTHFR 677 C>T (rs1801133) polymorphism, respectively. RESULTS: There was no evidence of association between the PHB 1630 C>T and MTHFR 677 C>T polymorphisms with either disease for BRCA1 or BRCA2 mutation carriers when breast and ovarian cancer associations were evaluated separately. Analysis that evaluated associations for breast and ovarian cancer simultaneously showed some evidence that BRCA1 mutation carriers who had the rare homozygote genotype (TT) of the PHB 1630 C>T polymorphism were at increased risk of both breast and ovarian cancer (HR 1.50, 95%CI 1.10-2.04 and HR 2.16, 95%CI 1.24-3.76, respectively). However, there was no evidence of association under a multiplicative model for the effect of each minor allele. CONCLUSION: The PHB 1630TT genotype may modify breast and ovarian cancer risks in BRCA1 mutation carriers. This association need to be evaluated in larger series of BRCA1 mutation carriers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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