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Enregistrement W2124517592 · doi:10.1161/atvb.35.suppl_1.110

Abstract 110: The Separation of Serum Amyloid A from HDL is Mediated by Heparan Sulfate Through Histidine Dependent Interactions: HDL Function is Enhanced but Amyloid-Fibrils may be the “Price to Pay”¼

2015· article· en· W2124517592 sur OpenAlexaff
John B. Ancsin, Kim Munro, Shui‐Pang Tam, Michael H. Davidson

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAmyloidosis: Diagnosis, Treatment, Outcomes
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerum amyloid AChemistryHeparan sulfateHeparinCircular dichroismAmyloid (mycology)GlycosaminoglycanApolipoprotein BBiochemistryLipoproteinHistidineSerum Amyloid A ProteinCholesterolBiologyImmunologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Serum amyloid A (SAA) is an acute-phase protein that circulates bound to high density lipoprotein (HDL) and can influence HDL function as part of a poorly understood defense re-sponse to tissue trauma or infection. We have previously demonstrated that under mildly acidic pH the glycosaminoglycans, heparan sulfate (HS) and heparin can interact with HDL-SAA and cause SAA to dissociate from HDL. This remodeling improves HDL functionality but also predisposes SAA to form AA-amyloid fibrils. In this study we explore some potential pathophysiological conditions in vitro that could influence this HS/HDL-SAA remodeling process and the fate of SAA in vivo. SAA’s binding affinity for heparin was found to be enhanced by acidic pH and low concentrations of urea. The heparin dependent remodeling of HDL-SAA was promoted by the partial denaturation of HDL-SAA. Moreover, HDL-SAA remodeling was observed to follow a strict SAA:heparin stoichiometry and could be partially inhibited with a short heparin oligosaccharide of 8-sugar units. Evidence is also presented that once dissociated from HDL, SAA requires additional time to organize into Triton x-100 resistant amyloid-like structures. Circular dichroism spectroscopic analysis and in silico modeling of SAA’s ionizable residues highlights the importance of the histidine-36 within a highly conserved, pH-sensitive HS-binding site (HSBS-pH). A peptide containing the HSBS-pH sequence was demonstrated to have AA-amyloid seeding activity in a cell culture system. The recent determination of the 3D structure for human SAA1.1 has allowed the opportunity to re-assess and validate the HS/heparin binding sequences that had previously been identified biochemically with short synthetic peptides. We postulate that the dissociation of SAA from HDL takes place during the retro-endocytosis of HDL-SAA and is an important aspect of SAA function not previously appreciated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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