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Enregistrement W2124634594 · doi:10.1186/1710-1492-9-9

Newly diagnosed chronic granulomatous disease in a 44 year old male presenting with recurrent groin cellulitis and colitis

2013· article· en· W2124634594 sur OpenAlexaffvenue
Arthur G Chung, Michael M Cyr, Anne K. Ellis

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueNeutrophil, Myeloperoxidase and Oxidative Mechanisms
Établissements canadiensKingston General HospitalMcMaster UniversityQueen's UniversityOakville-Trafalgar Memorial Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineChronic granulomatous diseasePrimary immunodeficiencyScrotumInguinal lymphadenopathyFamily historyPast medical historyGastroenterologySurgeryInternal medicinePathologyDiseaseImmunologyBiopsy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic Granulomatous Disease (CGD) is an inherited deficiency which results from the absence or dysfunction of nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) oxidase subunits in phagocytic cells. This condition is usually diagnosed in early childhood and presents with recurrent infections at epithelial surfaces such as the skin, lungs, and gut. We present a case of CGD which was diagnosed late in adulthood. A forty-four year old male was admitted to hospital with fever, testicular pain and an acute onset of swelling of his penis and scrotum. His past history was significant for Crohn’s disease diagnosed at age sixteen; stable on treatment with mesalamine (Asacol®). He also had recurrent soft tissue infections of his penis and/or scrotum since childhood, approximately 2 or 3 in total, to his recollection. There was no history of abscesses or sexually transmitted infections. However, the patient did complain of frequent upper respiratory tract infections each winter. He had no family history of primary immunodeficiency disease. During admission, he was assessed by urology and general surgery. Both confirmed the absence of any anatomic abnormalities. An immunologist suggested work up for immunodeficiency. Basic laboratory investigations were normal, with a white blood cell count of 7.8 × 10 L. C-reactive protein was elevated at 69.7 mg/L. Both his rheumatoid factor and HIV testing were negative. Serum levels of IgA, IgM and IgG levels were all within normal limits (Table 1 reports full details of his immunology investigations) Blood cultures were negative. A CT scan of the chest was normal. CT scan of the abdomen and pelvis revealed no subcutaneous air to suggest a necrotizing infection. Quantitative dihydrorhodamine (DHR)123 flow cytometry assay revealed the complete absence of an oxidative burst response; this was confirmed three times. This was suggestive of a neutrophil NADPH oxidase deficiency associated with CGD. The patient was treated with intravenous cefazolin and metronidazole and discharged home on clindamycin. His cellulitis resolved within weeks, but he experienced a recurrence approximately 6 months later. He was started on trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SMX), amoxicillin, and itraconazole as prophylactic therapy to prevent future infections. He was assessed by the Infectious Disease service, who simplified his prophylactic regimen to TMP-SMX 160/800 q Mon/Wed/Fri and Penicillin V K 300mg OD based on risk assessment and previous infective patterns. Interferon-gamma was considered, but based on restricted availability at the time and his relatively stable clinical course to date, we elected to pursue antibiotic prophylaxis and active surveillance alone. Genetic testing, performed by the Hospital for Sick Children in Toronto, confirmed a diagnosis of CGD and revealed a homozygous mutation in the NCFI gene (P47). It was recommended that directly family members receive DHR flow cytometry screening but this was declined.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0050,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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