La rougeole et son virus
Notice bibliographique
Résumé
Apres la diminution spectaculaire de la rougeole grâce a la vaccination, celle-ci est reapparue en 2008, ou 604 cas ont ete declares a l’Institut national de veille sanitaire (InVS), puis 1 544 cas en 2009 et 2 605 jusqu’en juin 2010. Parallelement, 86 souches virales ont ete identifiees au Centre national de reference de la rougeole et des Paramyxoviridae respiratoires (CNR) a partir de prelevements salivaires en 2008, 316 en 2009 et 946 jusqu’en aoUt 2010. La realite de l’epidemie est etayee par l’accroissement des cas endemiques : 0,9 cas pour 100 000 habitants en 2008 et quatre en 2010, la diffusion a toutes les regions francaises, et l’atteinte plus specifique des petits nourrissons : 4 % en 2008 et 9 % en 2010, et des sujets âges de 20 ans ou plus : 17 % en 2008 et 38 % en 2010. La majorite des cas (82 %) survient evidemment chez des sujets non vaccines contre la rougeole. Le nombre de cas hospitalises a augmente passant de 18 % en 2008 a 34 % en 2010. Le virus de l’epidemie est un genotype D4. Il apparait en 2008, puis s’etend en 2009 et 2010, representant 19, 75 et 99 % des virus caracterises. Tous les virus de ce genotype sont proches de la souche Montreal.CAN/89xD4 decrite en 1989. Au debut de l’epidemie en France, dans la region de Reims, quelques souches etaient proches du variant identifie en Angleterre en 2007 : MVs/Enfield.GBR/14.07(D4). Mais aujourd’hui la grande majorite d’entre elles (95 %) sont identiques a un variant qui a cause un petit foyer de rougeoles en Vendee au dernier trimestre 2008 : MVs/Montaigu.FRA/43.08(D4). Le diagnostic salivaire, qui a ete introduit en France a l’occasion de la declaration obligatoire de la rougeole, est tres efficace : 75 % des echantillons sont preleves dans les quatre premiers jours de l’eruption, et la recherche de l’ARN est positive dans 536 (81 %) des 660 salives recues au CNR jusqu’a ce jour en 2010 ; 136 (21 %) des salives contiennent des IgM anti-rougeole et 18 % n’ont ni ARN, ni IgM.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,012 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».