La rougeole et son virus
Notice bibliographique
Résumé
Apres la diminution spectaculaire de la rougeole grâce a la vaccination, celle-ci est reapparue en 2008, ou 604 cas ont ete declares a l’Institut national de veille sanitaire (InVS), puis 1 544 cas en 2009 et 2 605 jusqu’en juin 2010. Parallelement, 86 souches virales ont ete identifiees au Centre national de reference de la rougeole et des Paramyxoviridae respiratoires (CNR) a partir de prelevements salivaires en 2008, 316 en 2009 et 946 jusqu’en aoUt 2010. La realite de l’epidemie est etayee par l’accroissement des cas endemiques : 0,9 cas pour 100 000 habitants en 2008 et quatre en 2010, la diffusion a toutes les regions francaises, et l’atteinte plus specifique des petits nourrissons : 4 % en 2008 et 9 % en 2010, et des sujets âges de 20 ans ou plus : 17 % en 2008 et 38 % en 2010. La majorite des cas (82 %) survient evidemment chez des sujets non vaccines contre la rougeole. Le nombre de cas hospitalises a augmente passant de 18 % en 2008 a 34 % en 2010. Le virus de l’epidemie est un genotype D4. Il apparait en 2008, puis s’etend en 2009 et 2010, representant 19, 75 et 99 % des virus caracterises. Tous les virus de ce genotype sont proches de la souche Montreal.CAN/89xD4 decrite en 1989. Au debut de l’epidemie en France, dans la region de Reims, quelques souches etaient proches du variant identifie en Angleterre en 2007 : MVs/Enfield.GBR/14.07(D4). Mais aujourd’hui la grande majorite d’entre elles (95 %) sont identiques a un variant qui a cause un petit foyer de rougeoles en Vendee au dernier trimestre 2008 : MVs/Montaigu.FRA/43.08(D4). Le diagnostic salivaire, qui a ete introduit en France a l’occasion de la declaration obligatoire de la rougeole, est tres efficace : 75 % des echantillons sont preleves dans les quatre premiers jours de l’eruption, et la recherche de l’ARN est positive dans 536 (81 %) des 660 salives recues au CNR jusqu’a ce jour en 2010 ; 136 (21 %) des salives contiennent des IgM anti-rougeole et 18 % n’ont ni ARN, ni IgM.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».