Partial Characterization of Immunoglobulin C<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M1"><mml:mrow><mml:mi mathvariant="bold-italic">μ</mml:mi></mml:mrow></mml:math>Gene of Water Buffalo (<i>Bubalus bubalis</i>) Predicts Distinct Structural Features of C1q-Binding Site in C<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M2"><mml:mrow><mml:mi mathvariant="bold-italic">μ</mml:mi></mml:mrow></mml:math>3 Domain
Notice bibliographique
Résumé
Partial characterization of immunoglobulin C µ gene of water buffalo (Bubalus bubalis) revealed high amino acid sequence identity with C µ of cattle (94.28%) and sheep (91.71%). Four amino acid replacements (Met-301, Val-310, Asn-331, and Thr-432) in C µ 2, C µ 3, and C µ 4 of buffalo IgM are distinct, however. Unlike cattle, a codon deletion (GTG encoding valine at position 507 in cattle) and an insertion (GGC encoding glycine at position 532) occur in buffalo C µ 4. Three N-linked glycosylation (Asn-X-Thr/Ser) sites (one at position 325–327 in C µ 2; two at positions 372–374 and 394–396 in C µ 3) differentiate buffalo IgM from cattle and sheep. Similar to cattle, buffalo IgM has fewer prolines in C µ 2, which acts as hinge, which restricts Fab arm flexibility. Increased structural flexibility of the C1q-binding site in C µ 3 compensates for the rigid buffalo C µ 2 domain. Secondary structure of C1q-binding site is distinct in buffalo and cattle IgM where long alpha-helical structure is predominant that may be relevant to complement fixation function. Conserved protein motif “Thr-Cys-Thr-Val-Ala-His” provides protein signatures of C1q-binding region of ruminant species. The distinct structural features of C1q-binding site of buffalo and cattle IgM seem to be of functional significance and, therefore, useful in designing antibody based therapeutics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».