MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2125323572 · doi:10.1155/2013/676703

Partial Characterization of Immunoglobulin C<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M1"><mml:mrow><mml:mi mathvariant="bold-italic">μ</mml:mi></mml:mrow></mml:math>Gene of Water Buffalo (<i>Bubalus bubalis</i>) Predicts Distinct Structural Features of C1q-Binding Site in C<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M2"><mml:mrow><mml:mi mathvariant="bold-italic">μ</mml:mi></mml:mrow></mml:math>3 Domain

2013· article· lv· W2125323572 sur OpenAlexafffund
Surinder S. Saini, N. K. Maiti, Azad Kaushik

Notice bibliographique

RevueISRN Immunology · 2013
Typearticle
Languelv
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensUniversity of GuelphCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAlgorithmArtificial intelligenceMathematicsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Partial characterization of immunoglobulin C µ gene of water buffalo (Bubalus bubalis) revealed high amino acid sequence identity with C µ of cattle (94.28%) and sheep (91.71%). Four amino acid replacements (Met-301, Val-310, Asn-331, and Thr-432) in C µ 2, C µ 3, and C µ 4 of buffalo IgM are distinct, however. Unlike cattle, a codon deletion (GTG encoding valine at position 507 in cattle) and an insertion (GGC encoding glycine at position 532) occur in buffalo C µ 4. Three N-linked glycosylation (Asn-X-Thr/Ser) sites (one at position 325–327 in C µ 2; two at positions 372–374 and 394–396 in C µ 3) differentiate buffalo IgM from cattle and sheep. Similar to cattle, buffalo IgM has fewer prolines in C µ 2, which acts as hinge, which restricts Fab arm flexibility. Increased structural flexibility of the C1q-binding site in C µ 3 compensates for the rigid buffalo C µ 2 domain. Secondary structure of C1q-binding site is distinct in buffalo and cattle IgM where long alpha-helical structure is predominant that may be relevant to complement fixation function. Conserved protein motif “Thr-Cys-Thr-Val-Ala-His” provides protein signatures of C1q-binding region of ruminant species. The distinct structural features of C1q-binding site of buffalo and cattle IgM seem to be of functional significance and, therefore, useful in designing antibody based therapeutics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueISRN ImmunologyMême sujetMicrobial infections and disease researchTravaux en français237 207