Description of Colponema vietnamica sp.n. and Acavomonas peruviana n. gen. n. sp., Two New Alveolate Phyla (Colponemidia nom. nov. and Acavomonidia nom. nov.) and Their Contributions to Reconstructing the Ancestral State of Alveolates and Eukaryotes
Notice bibliographique
Résumé
The evolutionary and ecological importance of predatory flagellates are too often overlooked. This is not only a gap in our understanding of microbial diversity, but also impacts how we interpret their better-studied relatives. A prime example of these problems is found in the alveolates. All well-studied species belong to three large clades (apicomplexans, dinoflagellates, and ciliates), but the predatory colponemid flagellates are also alveolates that are rare in nature and seldom cultured, but potentially important to our understanding of alveolate evolution. Recently we reported the first cultivation and molecular analysis of several colponemid-like organisms representing two novel clades in molecular trees. Here we provide ultrastructural analysis and formal species descriptions for both new species, Colponema vietnamica n. sp. and Acavomonas peruviana n. gen. n. sp. Morphological and feeding characteristics concur with molecular data that both species are distinct members of alveolates, with Acavomonas lacking the longitudinal phagocytotic groove, a defining feature of Colponema. Based on ultrastructure and molecular phylogenies, which both provide concrete rationale for a taxonomic reclassification of Alveolata, we establish the new phyla Colponemidia nom. nov. for the genus Colponema and its close relatives, and Acavomonidia nom. nov. for the genus Acavomonas and its close relatives. The morphological data presented here suggests that colponemids are central to our understanding of early alveolate evolution, and suggest they also retain features of the common ancestor of all eukaryotes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».