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Enregistrement W2125485599 · doi:10.4319/lo.2003.48.3.1069

Photochemical reactivity of siderophores produced by marine heterotrophic bacteria and cyanobacteria based on characteristic Fe(III) binding groups

2003· article· en· W2125485599 sur OpenAlexaff
Katherine A. Barbeau, Eden L. Rue, Charles G. Trick, Kenneth W. Bruland, Alison Butler

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSiderophoreCarboxylateChemistryReactivity (psychology)FerricCyanobacteriaPhotochemistryBacteriaInorganic chemistryStereochemistryBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Siderophores, high‐affinity Fe(III) ligands produced by microorganisms to facilitate iron acquisition, might contribute significantly to dissolved Fe(III) complexation in ocean surface waters. In previous work, we demonstrated the photoreactivity of the ferric ion complexes of several α‐hydroxy carboxylic acid—containing siderophores produced by heterotrophic marine bacteria. Here, we expand on our earlier studies and detail the photoreactivity of additional siderophores produced by both heterotrophic marine bacteria and marine cyanobacteria, making comparisons to synthetic and terrestrial siderophores that lack the α‐hydroxy carboxylate group. Our results suggest that, in addition to secondary photochemical reaction pathways involving reactive oxygen species, direct photolysis of Fe(III)‐siderophore complexes might be a significant source of Fe(II) and reactive Fe(III) in ocean surface waters. Our findings further indicate that the photoreactivity of siderophores is primarily determined by the chemical structure of the Fe(III) binding groups that they possess—hydroxamate, catecholate, or α‐hydroxy carboxylate moieties. Hydroxamate groups are photochemically resistant regardless of Fe(III) complexation. Catecholates, in contrast, are susceptible to photooxidation in the uncomplexed form but stabilized against photooxidation when ferrated. α‐Hydroxy carboxylate groups are stable as the uncomplexed acid, but when coordinated to Fe(III), these moieties undergo light‐induced ligand oxidation and reduction of Fe(III) to Fe(II). These photochemical properties appear to determine the reactivity and fate of Fe(III)‐binding siderophores in ocean surface waters, which in turn might significantly influence the biogeochemical cycling of iron.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,771

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations256
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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