Three Epidemics of Invasive Multidrug-Resistant<i>Salmonella</i>Bloodstream Infection in Blantyre, Malawi, 1998–2014
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The Malawi Liverpool Wellcome Trust Clinical Research Programme (MLW) has routinely collected specimens for blood culture from febrile patients, and cerebrospinal fluid from patients with suspected meningitis, presenting to Queen Elizabeth Central Hospital (QECH), Blantyre, Malawi, since 1998. METHODS: We present bloodstream infection (BSI) and meningitis surveillance data from 1998 to 2014. Automated blood culture, manual speciation, serotyping, and antimicrobial susceptibility testing were performed at MLW. Population data for minimum-incidence estimates in urban Blantyre were drawn from published estimates. RESULTS: Between 1998 and 2014, 167,028 blood cultures were taken from adult and pediatric medical patients presenting to QECH; Salmonella Typhi was isolated on 2054 occasions (1.2%) and nontyphoidal Salmonella (NTS) serovars were isolated 10,139 times (6.1%), of which 8017 (79.1%) were Salmonella Typhimurium and 1608 (15.8%) were Salmonella Enteritidis. There were 392 cases of NTS meningitis and 9 cases of Salmonella Typhi meningitis. There have been 3 epidemics of Salmonella BSI in Blantyre; Salmonella Enteritidis from 1999 to 2002, Salmonella Typhimurium from 2002 to 2008, and Salmonella Typhi, which began in 2011 and was ongoing in 2014. Multidrug resistance has emerged in all 3 serovars and is seen in the overwhelming majority of isolates, while resistance to third-generation cephalosporins and fluoroquinolones is currently uncommon but has been identified. CONCLUSIONS: Invasive Salmonella disease in Malawi is dynamic and not clearly attributable to a single risk factor, although all 3 epidemics were associated with multidrug resistance. To inform nonvaccine and vaccine interventions, reservoirs of disease and modes of transmission require further investigation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».