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Enregistrement W2126429687 · doi:10.1139/b01-084

Gene sequence analysis of an opportunistic wheat pathogen, an isolate of<i>Fusarium proliferatum</i>

2001· article· en· W2126429687 sur OpenAlexvenueno aff
Sun-Il Kwon, Carol D. von Dohlen, Anne J. Anderson

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUtah Agricultural Experiment StationU.S. Department of Agriculture
Mots-clésFusarium proliferatumBiologyBotanyChlamydosporePotato dextrose agarFusariumGeneConidiumRibosomal RNAPhylogenetic treeEndophyteRibosomal DNAMicrobiologyAgarGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A fungal endophyte of wheat causing seedling necrosis when plants are grown under stressed conditions was identified as a Fusarium proliferatum (Matsushima) Nirenberg isolate (NRRL 31017). The wheat isolate grew rapidly on potato dextrose agar as lanose to cottony colonies and rarely produced macroconidia under ultraviolet light. Microconidia were produced both in false heads and chains; sporodochia and chlamydospores were not found. Phylogenetic analysis of the nucleotide sequences of the genes for β-tubulin, mitochondrial small subunit ribosomal DNA, calmodulin, and elongation factor 1-α from the wheat isolate showed affinity with other F. proliferatum isolates. The closest relationship was with an isolate with ligninolytic potential obtained from forest litter in Spain (F. proliferatum MUCL 31970). Nucleotide sequences of genes encoding laccases, which are quite divergent between fungal species, showed 99% identity between the wheat and the forest litter isolates.Key words: Fusarium proliferatum, laccase, phylogeny, genetic variability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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