RPAP1, a Novel Human RNA Polymerase II-Associated Protein Affinity Purified with Recombinant Wild-Type and Mutated Polymerase Subunits
Notice bibliographique
Résumé
We have programmed human cells to express physiological levels of recombinant RNA polymerase II (RNAPII) subunits carrying tandem affinity purification (TAP) tags. Double-affinity chromatography allowed for the simple and efficient isolation of a complex containing all 12 RNAPII subunits, the general transcription factors TFIIB and TFIIF, the RNAPII phosphatase Fcp1, and a novel 153-kDa polypeptide of unknown function that we named RNAPII-associated protein 1 (RPAP1). The TAP-tagged RNAPII complex is functionally active both in vitro and in vivo. A role for RPAP1 in RNAPII transcription was established by shutting off the synthesis of Ydr527wp, a Saccharomyces cerevisiae protein homologous to RPAP1, and demonstrating that changes in global gene expression were similar to those caused by the loss of the yeast RNAPII subunit Rpb11. We also used TAP-tagged Rpb2 with mutations in fork loop 1 and switch 3, two structural elements located strategically within the active center, to start addressing the roles of these elements in the interaction of the enzyme with the template DNA during the transcription reaction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».