Promoter Organization of the Interferon-A Genes Differentially Affects Virus-induced Expression and Responsiveness to TBK1 and IKK∈
Notice bibliographique
Résumé
Virus-induced expression of interferon (IFN)-A genes is regulated by two members of the IFN regulatory factor (IRF) family, IRF-3 and IRF-7, which are activated by phosphorylation during viral infection by the IKK-related serine/threonine kinases TBK1 and IkappaB kinase epsilon (IKKepsilon). In this study, we demonstrate that three IRF-binding sites located in the virus-responsive element mediate the transcriptional activation of the IFN-A4 promoter by IRF-3. The precise arrangement of these IRF elements is required for synergistic activation of the IFN-A4 promoter following Newcastle disease virus infection or activation by TBK1 or IKKepsilon. The ordered assembly of IRF-3 multimers on the promoter also determines cooperative recruitment of IRF-3 and CREB-binding protein and differential virus-induced expression of IFN-A4 gene promoter compared with IFN-A11. Naturally occurring nucleotide substitutions disrupt two of the IRF elements in the IFN-A11 gene promoter, leading to a dramatic decrease in IRF-3 and CREB-binding protein recruitment and in IRF-3-dependent transcription. Transcription of the IFN-A4 promoter by IRF-7 is mediated by two IRF elements; promoter mutants that carry a reversed IRF element retain the ability to respond to IKKepsilon or TBK1 expression in the presence of IRF-7 but lose the capacity to respond to virus or kinase-induced IRF-3. Interestingly, IKKepsilon or TBK1 stimulates the IRF-7-mediated transcription of IFN-A11, although at a lesser extent compared with IFN-A4. Our data indicate that virus-induced expression of IFN-A genes is dictated by the organization of IRF elements within the IFN-A promoters and that the differential IFN-A gene expression, based on the IRF-3 responsiveness, is partially compensated in the presence of IRF-7 when both factors are activated by IKKepsilon or TBK1.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».