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Enregistrement W2126593792 · doi:10.3390/cancers5020714

Genomic Instability: The Driving Force behind Refractory/Relapsing Hodgkin’s Lymphoma

2013· article· en· W2126593792 sur OpenAlexaff
Hans Knecht, Christiaan H. Righolt, Sabine Mai

Notice bibliographique

RevueCancers · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenome instabilityOncogeneCancer researchBiologyLymphomaGerminal centerTelomereGene expression profilingShelterinBCL6Chromosome instabilityGeneGene expressionTranscription factorGeneticsCell cycleImmunologyB cellDNA damageDNADNA-binding protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In classical Hodgkin's lymphoma (HL) the malignant mononuclear Hodgkin (H) and multinuclear, diagnostic Reed-Sternberg (RS) cells are rare and generally make up <3% of the total cellular mass of the affected lymph nodes. During recent years, the introduction of laser micro-dissection techniques at the single cell level has substantially improved our understanding of the molecular pathogenesis of HL. Gene expression profiling, comparative genomic hybridization analysis, micro-RNA expression profiling and viral oncogene sequencing have deepened our knowledge of numerous facets of H- and RS-cell gene expression deregulation. The question remains whether disturbed signaling pathways and deregulated transcription factors are at the origin of refractory/relapsing Hodgkin's lymphoma or whether these hallmarks are at least partially related to another major factor. We recently showed that the 3D nuclear organization of telomeres and chromosomes marked the transition from H- to RS-cells in HL cell lines. This transition is associated with progression of telomere dysfunction, shelterin disruption and progression of complex chromosomal rearrangements. We reported analogous findings in refractory/relapsing HL and identified the shelterin proteins TRF1, TRF2 and POT1 as targets of the LMP1 oncogene in post-germinal center B-cells. Here we summarize our findings, including data not previously published, and propose a model in which progressive disruption of nuclear integrity, a form of genomic instability, is the key-player in refractory/relapsing HL. Therapeutic approaches should take these findings into account.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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