Temporal expression of<i>Mycobacterium smegmatis</i>respiratory terminal oxidases
Notice bibliographique
Résumé
Terminal oxidases provide the final step in aerobic respiration by reducing oxygen. The mycobacteria possess two terminal oxidases: a cytochrome c aa3 type and a quinol bd type. We previously isolated a bd-type oxidase knockout mutant of Mycobacterium smegmatis that allowed for functional analysis of the aa3 type without the contribution of bd-type activity. Growth of M. smegmatis LR222 and JAM1 (LR222bd::kan) was monitored and the cytochrome content at different time points examined. No difference in aerobic growth was observed between M. smegmatis LR222 and JAM1. Membranes were obtained from these cultures and the oxidase concentrations were calculated from their spectrum. Although the mutant was producing only one oxidase type, this oxidase did not reach wild-type levels of expression, suggesting an additional mechanism for energizing the membrane. Moreover, the concentration of both oxidases in the wild-type strain dropped when cultures entered stationary phase, which was not the case for the aa3-type oxidase of the mutant strain. This oxidase remained at a constant concentration post mid-log phase. RNase protection assays also demonstrated late growth phase dependent message expression of the bd oxidase and that the subunits I and II genes were cotranscribed as an operon.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».