MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2127302438 · doi:10.1093/glycob/cwl010

Elucidation of the CMP-pseudaminic acid pathway in Helicobacter pylori: synthesis from UDP-N-acetylglucosamine by a single enzymatic reaction

2006· article· en· W2127302438 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesGenomic Health
Mots-clésFlagellinEnzymeBiochemistrySialic acidChemistryAcetylglucosamineNucleotide sugarGlycosylationHelicobacter pyloriBiosynthesisBacteriaN-AcetylglucosamineAmino sugarGlycanGlycosyltransferaseMicrobiologyStereochemistryGlycoproteinBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Flagellin glycosylation is a necessary modification allowing flagellar assembly, bacterial motility, colonization, and hence virulence for the gastrointestinal pathogen Helicobacter pylori [Josenhans, C., Vossebein, L., Friedrich, S., and Suerbaum, S. (2002) FEMS Microbiol. Lett., 210, 165-172; Schirm, M., Schoenhofen, I.C., Logan, S.M., Waldron, K.C., and Thibault, P. (2005) Anal. Chem., 77, 7774-7782]. A causative agent of gastric and duodenal ulcers, H. pylori, heavily modifies its flagellin with the sialic acid-like sugar 5,7-diacetamido-3,5,7,9-tetradeoxy-l-glycero-alpha-l-manno-nonulosonic acid (pseudaminic acid). Because this sugar is unique to bacteria, its biosynthetic pathway offers potential as a novel therapeutic target. We have identified six H. pylori enzymes, which reconstitute the complete biosynthesis of pseudaminic acid, and its nucleotide-activated form CMP-pseudaminic acid, from UDP-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc). The pathway intermediates and final product were identified from monitoring sequential reactions with nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, thereby confirming the function of each biosynthetic enzyme. Remarkably, the conversion of UDP-GlcNAc to CMP-pseudaminic acid was achieved in a single reaction combining six enzymes. This represents the first complete in vitro enzymatic synthesis of a sialic acid-like sugar and sets the groundwork for future small molecule inhibitor screening and design. Moreover, this study provides a strategy for efficient large-scale synthesis of novel medically relevant bacterial sugars that has not been attainable by chemical methods alone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,554

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle