The N-terminal Truncated Isoform of SOCS3 Translated from an Alternative Initiation AUG Codon under Stress Conditions Is Stable Due to the Lack of a Major Ubiquitination Site, Lys-6
Notice bibliographique
Résumé
The suppressor of cytokine signaling-3 (SOCS3/CIS-33/SSI-3) is an important negative regulator of cytokine signaling. Here, we show that an N-terminal truncated isoform (DeltaN-SOCS3) translated from the internal AUG codon 12 was profoundly induced by endoplasmic reticulum (ER) stress- or active double-stranded RNA-activated protein kinase PKR, as a result of induction of eukaryotic initiation factor 2alpha phosphorylation. DeltaN-SOCS3 exhibited a stronger cytokine-inhibitory activity and a higher stability than WT-SOCS3 in Ba/F3 hematopoietic cells. A potential ubiquitination residue, Lys-6, at the N terminus is evolutionary conserved among SOCS3 species. The K6Q-SOCS3 mutant showed a much longer half-life than WT-SOCS3 in Ba/F3 cells. Furthermore, inhibition of the 26 S proteasome pathway increased both ubiquitination and protein levels of WT-SOCS3 but had no effect on K6Q-SOCS3. SOCS3 mutant lacking the carboxyl-terminal SOCS-box exhibited the same stability as K6Q-SOCS3. These observations suggest that the short form of SOCS3 is a naturally occurring stabilized inhibitory protein, whereas WT-SOCS3 is a short-lived protein modulated by Lys-6 ubiquitination and proteasome-dependent degradation. Our findings provide strong evidence for the first time that translational control plays an important role in stabilization and function of SOCS3.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».