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Enregistrement W2128128123 · doi:10.1093/carcin/bgv031

Causes of genome instability: the effect of low dose chemical exposures in modern society

2015· review· en· W2128128123 sur OpenAlexaff
Sabine A. S. Langie, Gudrun Koppen, Daniel Desaulniers, Fahd Al‐Mulla, Rabeah Al‐Temaimi, Amedeo Amedei, Amaya Azqueta, William H. Bisson, Dustin G. Brown, Gunnar Brunborg, Amelia K. Charles, Tao Chen, Annamaria Colacci, F. Darroudi, Stefano Forte, Laetitia Gonzalez, Roslida Abd Hamid, Lisbeth E. Knudsen, Luc Leyns, Adela López de Ceráin, Lorenzo Memeo, Chiara Mondello, Carmel Mothersill, Ann‐Karin Olsen, Sofia Pavanello, Jayadev Raju, Emilio Rojas, Rabindra Roy, Elizabeth P. Ryan, Patricia Ostrosky‐Wegman, Hosni Salem, A. Ivana Scovassi, Neetu Singh, Monica Vaccari, Frederik‐Jan van Schooten, Mahara Valverde, Jordan Woodrick, Luoping Zhang, Nicolas Van Larebeke, Micheline Kirsch‐Volders, Andrew Collins

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensMcMaster UniversityMcMaster University Medical CentreHealth Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Cancer Institute
Mots-clésGenome instabilityEpigeneticsGenomeChromosome instabilityBiologyCarcinogenesisDNA damageDNA repairGeneticsTelomereDNAChromosomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genome instability is a prerequisite for the development of cancer. It occurs when genome maintenance systems fail to safeguard the genome's integrity, whether as a consequence of inherited defects or induced via exposure to environmental agents (chemicals, biological agents and radiation). Thus, genome instability can be defined as an enhanced tendency for the genome to acquire mutations; ranging from changes to the nucleotide sequence to chromosomal gain, rearrangements or loss. This review raises the hypothesis that in addition to known human carcinogens, exposure to low dose of other chemicals present in our modern society could contribute to carcinogenesis by indirectly affecting genome stability. The selected chemicals with their mechanisms of action proposed to indirectly contribute to genome instability are: heavy metals (DNA repair, epigenetic modification, DNA damage signaling, telomere length), acrylamide (DNA repair, chromosome segregation), bisphenol A (epigenetic modification, DNA damage signaling, mitochondrial function, chromosome segregation), benomyl (chromosome segregation), quinones (epigenetic modification) and nano-sized particles (epigenetic pathways, mitochondrial function, chromosome segregation, telomere length). The purpose of this review is to describe the crucial aspects of genome instability, to outline the ways in which environmental chemicals can affect this cancer hallmark and to identify candidate chemicals for further study. The overall aim is to make scientists aware of the increasing need to unravel the underlying mechanisms via which chemicals at low doses can induce genome instability and thus promote carcinogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations225
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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