MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2128165656 · doi:10.1111/2041-210x.12391

Near‐infrared spectroscopy (<scp>NIRS</scp>) predicts non‐structural carbohydrate concentrations in different tissue types of a broad range of tree species

2015· article· en· W2128165656 sur OpenAlexafffund
Jorge A. Ramírez, Juan M. Posada, I. Tanya Handa, Günter Hoch, Michael Vohland, Christian Messier, Björn Reu

Notice bibliographique

RevueMethods in Ecology and Evolution · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueRemote Sensing in Agriculture
Établissements canadiensUniversité du Québec en OutaouaisUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesNational Science Council
Mots-clésPartial least squares regressionCalibrationMean squared errorBiological systemSampling (signal processing)BiologyBotanyChemistryMathematicsStatisticsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary The allocation of non‐structural carbohydrates (NSCs) to reserves constitutes an important physiological mechanism associated with tree growth and survival. However, procedures for measuringNSCin plant tissue are expensive and time‐consuming. Near‐infrared spectroscopy (NIRS) is a high‐throughput technology that has the potential to infer the concentration of organic constituents for a large number of samples in a rapid and inexpensive way based on empirical calibrations with chemical analysis. The main objectives of this study were (i) to develop a generalNSCconcentration calibration that integrates various forms of variation such as tree species and tissue types and (ii) to identify characteristic spectral regions associated withNSCmolecules. In total, 180 samples from different tree organs (root, stem, branch, leaf) belonging to 73 tree species from tropical and temperate biomes were analysed. Statistical relationships betweenNSCconcentration andNIRSspectra were assessed using partial least squares regression (PLSR) and a variable selection procedure (competitive adaptive reweighted sampling,CARS), in order to identify key wavelengths. Parsimonious and accurate calibration models were obtained for totalNSC(r2of 0·91,RMSEof 1·34% in external validation), followed by starch (r2 = 0·85 andRMSE = 1·20%) and sugars (r2 = 0·82 andRMSE = 1·10%). Key wavelengths coincided among these models and were mainly located in the 1740–1800, 2100–2300 and 2410–2490 nm spectral regions. This study demonstrates the ability of general calibration model to inferNSCconcentrations across species and tissue types in a rapid and cost‐effective way. The estimation ofNSCin plants usingNIRStherefore serves as a tool for functional biodiversity research, in particular for the study of the growth–survival trade‐off and its implications in response to changing environmental conditions, including growth limitation and mortality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMethods in Ecology and EvolutionMême sujetRemote Sensing in AgricultureTravaux en français237 207