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Enregistrement W2128366978 · doi:10.1128/jcm.42.8.3570-3574.2004

Characterization and Prevalence of MefA, MefE, and the Associated <i>msr</i> (D) Gene in <i>Streptococcus pneumoniae</i> Clinical Isolates

2004· article· en· W2128366978 sur OpenAlexaboutno aff
Melissa M. Daly, Stella Z. Doktor, Robert K. Flamm, Dee Shortridge

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStreptococcus pneumoniaeOpen reading frameEffluxMicrobiologyGeneStrain (injury)BiologyGeneticsAntibioticsPeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent work has shown that the efflux genes in Streptococcus pneumoniae that are responsible for acquired macrolide resistance can be distinguished as either mef(E) or mef(A). The genetic elements on which mef(A) and mef(E) are found also carry an open reading frame (ORF) that is 56% homologous to msr(A) in Staphylococcus. The prevalence of mef(A/E) and of the msr-like ORF [msr(D)] was evaluated in 153 mef(+) S. pneumoniae clinical isolates collected in North America, Europe, Africa, and Asia from 1997 to 2002. Clinical isolates were screened with PCR primers specific for either mef(A) or mef(E) and for msr(D). mef(A), mef(E), and msr(D) were cloned from mef(+) strains and transformed into a susceptible, competent strain of S. pneumoniae. The transformants were tested for antimicrobial susceptibilities and efflux pump induction. The results of this work demonstrated that mef(A) is more often isolated in parts of Europe, with some incidence in Canada, and that the msr-like gene alone can confer the efflux phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,419
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations123
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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