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Enregistrement W2129113026 · doi:10.1093/infdis/jiq102

The Y238X Stop Codon Polymorphism in the Human β-Glucan Receptor Dectin-1 and Susceptibility to Invasive Aspergillosis

2011· article· en· W2129113026 sur OpenAlexaff
Louis Yi Ann Chai, Mark de Boer, Walter J. F. M. van der Velden, Theo S. Plantinga, Annemiek B. van Spriel, Cor Jacobs, Constantijn J.M. Halkes, Alieke G. Vonk, Nicole M. A. Blijlevens, Jaap T. van Dissel, Peter Donnelly, Bart Jan Kullberg, Johan Maertens, Mihai G. Netea

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesRadboud Universitair Medisch CentrumLeids Universitair Medisch Centrum
Mots-clésBiologyAspergillosisImmunologyHematopoietic stem cell transplantationLoss of heterozygosityGenotypeImmune systemAlleleAspergillusOdds ratioMyeloidStem cellInternal medicineGeneticsMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Dectin-1 is the major receptor for fungal β-glucans on myeloid cells. We investigated whether defective Dectin-1 receptor function, because of the early stop codon polymorphism Y238X, enhances susceptibility to invasive aspergillosis (IA) in at-risk patients. METHODS: Association of Dectin-1 Y238X polymorphism with occurrence and clinical course of IA was evaluated in 71 patients who developed IA post hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) and in another 21 non-HSCT patients with IA. The control group consisted of 108 patients who underwent HSCT. Functional studies were performed to investigate consequences of the Y238X Dectin-1 polymorphism. RESULTS: The Y238X allele frequency was higher in non-HSCT patients with IA (19.0% vs 6.9%-7.7%; P < .05). Heterozygosity for Y238X polymorphism in HSCT recipients showed a trend toward IA susceptibility (odds ratio, 1.79; 95% CI, .77-4.19; P = .17) but did not influence clinical course of IA. Functional assays revealed that although peripheral blood mononuclear cells with defective Dectin-1 function due to Y238X responded less efficiently to Aspergillus, corresponding macrophages showed adequate response to Aspergillus. CONCLUSIONS: Dectin-1 Y238X heterozygosity has a limited influence on susceptibility to IA and may be important in susceptible non-HSCT patients. This is partly attributable to redundancy inherent in the innate immune system. Larger studies are needed to confirm these findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations116
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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