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Enregistrement W2129331946 · doi:10.1200/jco.2012.48.5052

Subgroup-Specific Prognostic Implications of <i>TP53</i> Mutation in Medulloblastoma

2013· article· en· W2129331946 sur OpenAlexaff
Nataliya Zhukova, Vijay Ramaswamy, Marc Remke, Elke Pfaff, David Shih, Dianna C. Martin, Pedro Castelo‐Branco, Berivan Baskin, Peter N. Ray, Éric Bouffet, André O. von Bueren, David Jones, Paul A. Northcott, Marcel Kool, Dominik Sturm, Trevor J. Pugh, Scott L. Pomeroy, Yoon-Jae Cho, Torsten Pietsch, Marco Gessi, Stefan Rutkowski, László Bognár, Álmos Klekner, Byung-Kyu Cho, Seung‐Ki Kim, Kyu‐Chang Wang, Charles G. Eberhart, Michelle Fèvre‐Montange, Maryam Fouladi, Pim J. French, Max Kros, Wiesława Grajkowska, Nalin Gupta, William A. Weiss, Péter Hauser, Nada Jabado, Anne Jouvet, Shin Jung, Toshihiro Kumabe, Bolesław Lach, Jeffrey R. Leonard, Joshua B. Rubin, Linda M. Liau, Luca Massimi, Ian F. Pollack, Young Seob Shin, Erwin G. Van Meir, Karel Zitterbart, Ulrich Schüller, Rebecca M. Hill, Janet C. Lindsey, Ed C. Schwalbe, Simon Bailey, David W. Ellison, Cynthia Hawkins, David Malkin, Steven C. Clifford, Andrey Korshunov, Stefan M. Pfister, Michael D. Taylor, Uri Tabori

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensJuravinski Cancer Centre
Organismes subventionnairesUniversity of California, Los AngelesHospices Civils de LyonMasarykova UniverzitaErasmus Medisch CentrumUniversity of UlsanEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentSeoul National UniversityBrain Tumour CharityChonnam National UniversityUniversité de LyonSemmelweis EgyetemNewcastle UniversityDebreceni EgyetemCancer Research UKAction Medical ResearchChildren's Cancer and Leukaemia GroupDeutsche KrebshilfeUniversity of CincinnatiUniversity of PittsburghChonnam National University Hwasun HospitalJohns Hopkins UniversityNational Cancer InstituteEmory University
Mots-clésMedulloblastomaSonic hedgehogWnt signaling pathwayMedicineMutationOncologyCohortCancer researchPTCH1GermlineInternal medicineMutantBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Reports detailing the prognostic impact of TP53 mutations in medulloblastoma offer conflicting conclusions. We resolve this issue through the inclusion of molecular subgroup profiles. PATIENTS AND METHODS: We determined subgroup affiliation, TP53 mutation status, and clinical outcome in a discovery cohort of 397 medulloblastomas. We subsequently validated our results on an independent cohort of 156 medulloblastomas. RESULTS: TP53 mutations are enriched in wingless (WNT; 16%) and sonic hedgehog (SHH; 21%) medulloblastomas and are virtually absent in subgroups 3 and 4 tumors (P < .001). Patients with SHH/TP53 mutant tumors are almost exclusively between ages 5 and 18 years, dramatically different from the general SHH distribution (P < .001). Children with SHH/TP53 mutant tumors harbor 56% germline TP53 mutations, which are not observed in children with WNT/TP53 mutant tumors. Five-year overall survival (OS; ± SE) was 41% ± 9% and 81% ± 5% for patients with SHH medulloblastomas with and without TP53 mutations, respectively (P < .001). Furthermore, TP53 mutations accounted for 72% of deaths in children older than 5 years with SHH medulloblastomas. In contrast, 5-year OS rates were 90% ± 9% and 97% ± 3% for patients with WNT tumors with and without TP53 mutations (P = .21). Multivariate analysis revealed that TP53 status was the most important risk factor for SHH medulloblastoma. Survival rates in the validation cohort mimicked the discovery results, revealing that poor survival of TP53 mutations is restricted to patients with SHH medulloblastomas (P = .012) and not WNT tumors. CONCLUSION: Subgroup-specific analysis reconciles prior conflicting publications and confirms that TP53 mutations are enriched among SHH medulloblastomas, in which they portend poor outcome and account for a large proportion of treatment failures in these patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,189
Score d'incertitude au seuil0,247

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,431
Écart entre enseignants0,339 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations488
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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