Genetic Analysis Identifies a Function for the <i>queC</i> ( <i>ybaX</i> ) Gene Product at an Initial Step in the Queuosine Biosynthetic Pathway in <i>Escherichia coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
Queuosine (Q), one of the most complex modifications occurring at the wobble position of tRNAs with GUN anticodons, is implicated in a number of biological activities, including accuracy of decoding, virulence, and cellular differentiation. Despite these important implications, its biosynthetic pathway has remained unresolved. Earlier, we observed that a naturally occurring strain of Escherichia coli B105 lacked Q modification in the tRNAs. In the present study, we developed a genetic screen to map the defect in E. coli B105 to a single gene, queC (renamed from ybaX), predicted to code for a 231-amino-acid-long protein with a pI of 5.6. As analyzed by mobility of tRNA(Tyr) on acid urea gels and two-dimensional thin-layer chromatography of the modified nucleosides, expression of QueC from a plasmid-borne copy confers a Q+ phenotype to E. coli B105. Further, analyses of tRNA(Tyr) from E. coli JE10651 (queA mutant), its derivative generated by deletion of chromosomal queC (queA deltaqueC), and E. coli JE7325, deficient in converting preQ0 to preQ1, have provided the first genetic evidence for the involvement of QueC at a step leading to production of preQ0, the first known intermediate in the generally accepted pathway that utilizes GTP as the starting molecule. In addition, we discuss the possibilities of collaboration of QueC with other cellular proteins in the production of preQ0.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».