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Enregistrement W2129532417 · doi:10.3201/eid1607.100106

<i>Cryptococcus gattii</i>Genotype VGIIa Infection in Man, Japan, 2007

2010· article· en· W2129532417 sur OpenAlexaboutno aff
Koh Okamoto, Shuji Hatakeyama, Satoru Itoyama, Yoko Nukui, Yusuke Yoshino, Takatoshi Kitazawa, Hiroshi Yotsuyanagi, Reiko Ikeda, Takashi Sugita, Kazuhiko Koike

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Tokyo
Mots-clésCryptococcus gattiiOutbreakGenotypeStrain (injury)VirulenceVirologyCryptococcosisBiologyCryptococcusMicrobiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report a patient in Japan infected with Cryptococcus gattii genotype VGIIa who had no recent history of travel to disease-endemic areas.This strain was identical to the Vancouver Island outbreak strain R265.Our results suggest that this virulent strain has spread to regions outside North America.C ryptococcus neoformans and C. gattii are closely re- lated species of yeast; C. gattii was previously classifi ed as C. neoformans var.gattii (1).Although both species cause pulmonary or central nervous system infections, they differ in their ecology, epidemiology, and pathobiology.C. neoformans is the most common Cryptococcus spp.worldwide and mainly affects immunocompromised hosts.In contrast, C. gattii mainly affects immunocompetent hosts and often forms mass-like lesions (cryptococcomas).Multilocus sequence typing can be used to divide this species into 4 molecular genotypes, VGI-VGIV, which differ in epidemiology and virulence (1,2).C. gattii was believed to be restricted to tropical and subtropical areas such as Australia, Southeast Asia, and South America (1).However, in 1999, a C. gattii infection outbreak occurred on Vancouver Island, British Columbia, Canada (3), which has a temperate climate.During the Vancouver Island outbreak, most human, animal, and environmental isolates obtained belonged to VGIIa (major genotype, 90%-95% of isolates) and VGIIb (minor genotype, 5%-10% of isolates) (2,3).These strains have now spread to mainland British Columbia and the Pacifi c Northwest region of the United States (1,4,5).The potential for further spread of this strain, particularly the VGIIa genotype, is a serious concern because it is highly virulent in mammals and can infect immunocompetent persons (2).We report a case of cerebral cryptococcoma caused by C. gattii VGIIa (a strain identical to the Vancouver Island outbreak major genotype strain R265) in a patient from Japan who had no recent travel history to known diseaseendemic areas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,047

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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