Functional Analysis of the Noncoding Regions of the Uukuniemi Virus ( <i>Bunyaviridae</i> ) RNA Segments
Notice bibliographique
Résumé
The role of the variable portion of the noncoding regions (NCRs) of the three Bunyaviridae RNA segments (L, M, S) in transcription, replication, and packaging was studied using the recently developed plasmid-driven RNA polymerase I minigenome system for Uukuniemi (UUK) virus, genus Phlebovirus (11), as a model. Comparison of the different segments showed that all NCRs were sufficient to mediate transcription/replication of a minigenome but demonstrated decreased promoter strength in the order M > L > S. Chimeric minigenomes with flanking NCRs from different genome segments revealed that the number of total base pairs within the inverted, partially complementary ends was important for transcription and replication. Point mutations increasing the base-pairing potential produced increased reporter expression, indicating that complementarity between the 5' and 3' ends is crucial for promoter activity. The role of the intergenic region (IGR) located between the two open reading frames of the ambisense UUK virus S segment was analyzed by inserting this sequence element downstream of the reporter genes. The presence of the IGR was found to enhance reporter expression, demonstrating that efficient transcription termination, regulated by the IGR, is important for optimal minigenome mRNA translation. Finally, genome packaging efficacy varied for different NCRs and was strongest for L followed by M and S. Strong reporter gene activity was still observed after seven consecutive cell culture passages, indicating a selective rather than random genome-packaging mechanism. In summary, our results demonstrate that the NCRs from all three segments contain the necessary signals to initiate transcription and replication as well as packaging. Based on promoter strength, M-segment NCRs may be the preferred choice for the development of reverse genetics and minigenome rescue systems for bunyaviruses.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».