FpvIR Control of <i>fpvA</i> Ferric Pyoverdine Receptor Gene Expression in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> : Demonstration of an Interaction between FpvI and FpvR and Identification of Mutations in Each Compromising This Interaction
Notice bibliographique
Résumé
FpvR is a presumed cytoplasmic membrane-associated anti-sigma factor that controls the activities of extracytoplasmic function sigma factors PvdS and FpvI responsible for transcription of pyoverdine biosynthetic genes and the ferric pyoverdine receptor gene, fpvA, respectively. Using deletion analysis and an in vivo bacterial two-hybrid system, FpvR interaction with these sigma factors was confirmed and shown to involve the cytoplasmic N-terminal 67 amino acid resides of FpvR. FpvR bound specifically to a C-terminal region of FpvI corresponding to region 4 of the sigma(70) family of sigma factors. FpvR and FpvI mutant proteins compromised for this interaction were generated by random and site-directed PCR mutagenesis and invariably contained secondary structure-altering proline substitution in predicted alpha-helices within the FpvR N terminus or FpvI region 4. PvdS was shown to bind to the same N-terminal region of FpvR, and FpvR mutations compromising FpvI binding also compromised PvdS binding, although some mutations had a markedly greater impact on PvdS binding. Apparently, these two sigma factors bind to FpvR in a substantially similar but not identical fashion. Intriguingly, defects in FpvR binding correlated with a substantial drop in yields of the FpvI and to a lesser extent PvdS sigma factors, suggesting that FpvR-bound FpvI and PvdS are stable while free and active sigma factor is prone to turnover.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».