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Enregistrement W2129687578 · doi:10.1038/nbt.1823

Minimum information about a marker gene sequence (MIMARKS) and minimum information about any (x) sequence (MIxS) specifications

2011· article· en· W2129687578 sur OpenAlexaff
Pelin Yilmaz, Renzo Kottmann, Dawn Field, Rob Knight, James R. Cole, Linda Amaral‐Zettler, Jack A. Gilbert, Ilene Karsch‐Mizrachi, Anjanette Johnston, Guy Cochrane, Robert Vaughan, Chris Hunter, Joonhong Park, Norman Morrison, Philippe Rocca‐Serra, Peter Sterk, Manimozhiyan Arumugam, Mark Bailey, Laura K. Baumgartner, Bruce W. Birren, Martin J. Blaser, Vivien Bonazzi, Tim Booth, Peer Bork, Frederic D. Bushman, Pier Luigi Buttigieg, Patrick Chain, Emily S. Charlson, Elizabeth K. Costello, Heather Huot-Creasy, Peter Dawyndt, Todd Z. DeSantis, Noah Fierer, Jed A. Fuhrman, Rachel E. Gallery, Dirk Gevers, Richard A. Gibbs, Inigo San Gil, Antonio González, Jeffrey I. Gordon, Robert M. Guralnick, Wolfgang Hankeln, Sarah K. Highlander, Philip Hugenholtz, Janet Jansson, Andrew L. Kau, Scott T. Kelley, Jerry Kennedy, Dan Knights, Omry Koren, Justin Kuczynski, Nikos C. Kyrpides, Robert D. Larsen, Christian L. Lauber, Teresa Legg, Ruth E. Ley, Catherine Lozupone, Wolfgang Ludwig, Donna Lyons, Eamonn Maguire, Barbara A. Methé, Folker Meyer, Brian D. Muegge, Sara Nakielny, Diana R. Nemergut, Josh D. Neufeld, Lindsay K. Newbold, Anna Oliver, Norman R. Pace, Jörg Peplies, Joseph F. Petrosino, Lita M. Proctor, Elmar Pruesse, Christian Quast, Jeroen Raes, Sujeevan Ratnasingham, Jacques Ravel, David A. Relman, Susanna‐Assunta Sansone, Patrick D. Schloss, Lynn M. Schriml, Rohini Sinha, Michelle I. Smith, Erica Sodergren, Aymé Spor, Jesse Stombaugh, James M. Tiedje, Doyle V. Ward, George M. Weinstock, Doug Wendel, Owen White, Andrew S. Whiteley, Andreas Wilke, Jennifer R. Wortman, Tanya Yatsunenko, Frank Oliver Glöckner

Notice bibliographique

RevueNature Biotechnology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNatural Environment Research CouncilSight Research UKNational Human Genome Research InstituteHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésSequence (biology)GeneGeneticsBiologyComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,045

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,011

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations809
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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