Crystal structure of methenyltetrahydrofolate synthetase from <i>Mycoplasma pneumoniae</i> (GI: 13508087) at 2.2 Å resolution
Notice bibliographique
Résumé
Introduction. The enzyme 5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase (MTHFS), also known as 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, is involved in folate metabolism. MTHFS catalyzes the obligatory initial metabolic step in the intracellular irreversible conversion of 5-formyltetrahydrofolate to other reduced folates, which requires ATP and magnesium. The product is then interconverted into other reduced folates involved in one-carbon metabolism. The reduced tetrahydrofolates (THFs) serve as cofactors that carry one-carbon moieties for the de novo synthesis of purines (supply the number 2 and number 8 carbons of the purine ring) and thymidylate (used for the methylation of dUMP to dTMP), and for the remethylation of homocysteine to methionine. 6] MTHFS from Mycoplasma pneumoniae shares significant sequence homology with human MTHFS. Although sequence information for MTHFS from various organisms is available, no structural information for this family of enzymes has been obtained. To provide a structural basis for understanding the function of the MTHFS protein family, we have determined the crystal structure of M. pneumoniae MTHFS at 2.2 resolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».