The HEAT Repeat Protein ILITYHIA is Required for Plant Immunity
Notice bibliographique
Résumé
Plant innate immunity is mediated in part by resistance (R) proteins that detect pathogens and mount a robust defense response to fight against infection. We previously characterized proteins in the MOS4-associated complex (MAC) that function in the regulation of plant immune responses downstream of the autoactivated R protein snc1. The MAC is a highly conserved spliceosome-associated complex homologous to the nineteen complex (NTC) in yeast and human. The availability of proteomics data sets in these organisms allowed us to systematically test the biological function of additional putative MAC proteins based on protein sequence homology and reverse genetics. In this study, we investigate the function of the GENERAL CONTROL NONDEREPRESSIBLE1 (GCN1) homolog in Arabidopsis. GCN1 was previously isolated as a novel component of the NTC in one proteomics study of the human spliceosome. We identified a single GCN1 homolog in Arabidopsis and partially characterized its function using available T-DNA insertion mutants. This locus, previously named ILITYHIA (ILA), is required for non-host and basal resistance against Pseudomonas syringae as well as resistance conditioned by specific nucleotide binding, leucine-rich repeat (NB-LRR) R proteins. Furthermore, ILA is required for systemic acquired resistance (SAR). Previous proteomic identification of MAC components in Arabidopsis did not identify ILA, and epistasis analysis between snc1 and ila revealed that ILA does not function in snc1-mediated resistance. Overall, our results show that ILA functions in immunity against bacterial infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».