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Enregistrement W2129907572 · doi:10.1093/pcp/pcq038

The HEAT Repeat Protein ILITYHIA is Required for Plant Immunity

2010· article· en· W2129907572 sur OpenAlexafffund
Jacqueline Monaghan, Xin Li

Notice bibliographique

RevuePlant and Cell Physiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of British Columbia
Mots-clésArabidopsisPseudomonas syringaeBiologyGeneticsEffectorSpliceosomeProteomicsPlant ImmunitySystemic acquired resistanceInnate immune systemMutantCell biologyComputational biologyGeneRNA splicingImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant innate immunity is mediated in part by resistance (R) proteins that detect pathogens and mount a robust defense response to fight against infection. We previously characterized proteins in the MOS4-associated complex (MAC) that function in the regulation of plant immune responses downstream of the autoactivated R protein snc1. The MAC is a highly conserved spliceosome-associated complex homologous to the nineteen complex (NTC) in yeast and human. The availability of proteomics data sets in these organisms allowed us to systematically test the biological function of additional putative MAC proteins based on protein sequence homology and reverse genetics. In this study, we investigate the function of the GENERAL CONTROL NONDEREPRESSIBLE1 (GCN1) homolog in Arabidopsis. GCN1 was previously isolated as a novel component of the NTC in one proteomics study of the human spliceosome. We identified a single GCN1 homolog in Arabidopsis and partially characterized its function using available T-DNA insertion mutants. This locus, previously named ILITYHIA (ILA), is required for non-host and basal resistance against Pseudomonas syringae as well as resistance conditioned by specific nucleotide binding, leucine-rich repeat (NB-LRR) R proteins. Furthermore, ILA is required for systemic acquired resistance (SAR). Previous proteomic identification of MAC components in Arabidopsis did not identify ILA, and epistasis analysis between snc1 and ila revealed that ILA does not function in snc1-mediated resistance. Overall, our results show that ILA functions in immunity against bacterial infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,653
Score d'incertitude au seuil0,612

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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