MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2130245071 · doi:10.1093/rheumatology/kem265

HLA class II haplotype and autoantibody associations in children with juvenile dermatomyositis and juvenile dermatomyositis–scleroderma overlap

2007· article· en· W2130245071 sur OpenAlexfundno aff
Lucy R. Wedderburn, N. McHugh, Hector Chinoy, Robert G. Cooper, Fiona Salway, W E Ollier, Liza McCann, Hemlata Varsani, J. Englebert Dunphy, J. North, J. E. Davidson

Notice bibliographique

RevueLara D. Veeken · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory Myopathies and Dermatomyositis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHospital for Sick Children
Mots-clésJuvenile dermatomyositisMedicineSerologyDermatomyositisHaplotypeGenotypingAutoantibodyImmunologyHuman leukocyte antigenInternal medicineAntibodyGenotypeAntigenGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: To investigate a large cohort of children with juvenile dermatomyositis (JDM), and those with JDM-scleroderma (JDM-SSc) overlap, using detailed serological analysis, HLA class II genotyping and clinical characterization. METHODS: Children (114) with JDM were recruited, and clinical data collected, through the JDM National Registry and Repository (UK and Ireland). Sera were assayed for ANA using standard immunofluorescence techniques and specific antibodies characterized using ELISA, immunodiffusion and radioimmunoprecipitation. Patients and controls (n = 537) were genotyped at the HLA-DRB1 and DQB1 loci, and then the DQA1 locus data was derived. RESULTS: Over 70% of the patients were ANA-positive. Clear differences in serological and genetic data were demonstrated between JDM and JDM-SSc overlap groups. Strong associations were seen for HLA-DRB1*03 (all cases vs controls, P(corr) = 0.02; JDM-SSc vs controls, P(corr) = 0.001) and HLA-DQA1*05 (all cases vs controls, P(corr) = 0.01; JDM-SSc vs controls, P(corr) = 0.005). The frequency of the HLA-DRB1*03-DQA1*05-DQB1*02 haplotype was significantly increased in the JDM-SSc (P = 0.003) and anti-PM-Scl antibody (P = 0.002) positive groups. All anti-U1-RNP antibody-positive patients had at least one copy of HLA-DRB1*04-DQA1*03-DQB1*03 haplotype. Associations were observed between serology and specific clinical features. CONCLUSIONS: We present clinical data, HLA genotyping and serological profiling on a large cohort of JDM patients and a carefully characterized subset of patients with JDM-SSc overlap. The results confirm known HLA associations and extend the knowledge by stratification of data in serological and clinical subgroups. In the future, a combination of serological and genetic typing may allow for better prediction of clinical course and disease subtype in JDM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLara D. VeekenMême sujetInflammatory Myopathies and DermatomyositisTravaux en français237 207